Protein–RNA interactions for Protein: P62256

UBE2H, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 H, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2HP62256 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE2HP62256 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE2HP62256 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE2HP62256 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE2HP62256 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE2HP62256 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE2HP62256 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE2HP62256 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE2HP62256 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE2HP62256 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE2HP62256 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE2HP62256 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE2HP62256 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBE2HP62256 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBE2HP62256 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBE2HP62256 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
UBE2HP62256 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBE2HP62256 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBE2HP62256 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBE2HP62256 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBE2HP62256 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBE2HP62256 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBE2HP62256 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBE2HP62256 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBE2HP62256 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBE2HP62256 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBE2HP62256 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBE2HP62256 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBE2HP62256 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBE2HP62256 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBE2HP62256 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBE2HP62256 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBE2HP62256 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBE2HP62256 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBE2HP62256 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBE2HP62256 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBE2HP62256 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
UBE2HP62256 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBE2HP62256 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBE2HP62256 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBE2HP62256 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBE2HP62256 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBE2HP62256 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBE2HP62256 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBE2HP62256 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBE2HP62256 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBE2HP62256 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBE2HP62256 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBE2HP62256 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBE2HP62256 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBE2HP62256 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
UBE2HP62256 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBE2HP62256 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBE2HP62256 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBE2HP62256 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBE2HP62256 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBE2HP62256 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBE2HP62256 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBE2HP62256 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBE2HP62256 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBE2HP62256 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBE2HP62256 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBE2HP62256 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBE2HP62256 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBE2HP62256 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBE2HP62256 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBE2HP62256 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBE2HP62256 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBE2HP62256 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBE2HP62256 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
UBE2HP62256 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
UBE2HP62256 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
UBE2HP62256 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBE2HP62256 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBE2HP62256 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBE2HP62256 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBE2HP62256 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBE2HP62256 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBE2HP62256 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBE2HP62256 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBE2HP62256 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBE2HP62256 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
UBE2HP62256 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBE2HP62256 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBE2HP62256 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBE2HP62256 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBE2HP62256 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBE2HP62256 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBE2HP62256 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBE2HP62256 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBE2HP62256 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
UBE2HP62256 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
UBE2HP62256 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
UBE2HP62256 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
UBE2HP62256 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
UBE2HP62256 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
UBE2HP62256 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBE2HP62256 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBE2HP62256 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBE2HP62256 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms