Protein–RNA interactions for Protein: P62191

PSMC1, 26S proteasome regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC1P62191 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMC1P62191 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMC1P62191 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMC1P62191 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMC1P62191 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMC1P62191 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMC1P62191 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMC1P62191 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMC1P62191 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMC1P62191 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMC1P62191 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMC1P62191 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMC1P62191 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMC1P62191 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMC1P62191 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMC1P62191 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMC1P62191 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMC1P62191 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMC1P62191 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMC1P62191 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMC1P62191 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMC1P62191 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMC1P62191 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMC1P62191 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMC1P62191 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMC1P62191 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMC1P62191 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMC1P62191 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMC1P62191 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMC1P62191 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMC1P62191 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMC1P62191 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMC1P62191 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMC1P62191 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMC1P62191 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMC1P62191 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMC1P62191 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMC1P62191 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMC1P62191 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMC1P62191 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMC1P62191 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMC1P62191 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMC1P62191 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMC1P62191 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMC1P62191 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMC1P62191 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMC1P62191 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMC1P62191 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMC1P62191 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMC1P62191 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMC1P62191 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMC1P62191 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMC1P62191 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMC1P62191 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMC1P62191 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMC1P62191 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMC1P62191 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMC1P62191 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMC1P62191 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMC1P62191 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMC1P62191 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMC1P62191 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMC1P62191 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMC1P62191 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMC1P62191 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMC1P62191 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMC1P62191 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMC1P62191 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMC1P62191 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMC1P62191 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMC1P62191 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PSMC1P62191 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMC1P62191 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMC1P62191 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMC1P62191 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMC1P62191 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMC1P62191 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMC1P62191 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMC1P62191 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMC1P62191 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMC1P62191 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMC1P62191 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMC1P62191 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMC1P62191 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMC1P62191 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMC1P62191 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMC1P62191 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMC1P62191 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMC1P62191 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMC1P62191 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMC1P62191 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMC1P62191 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMC1P62191 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMC1P62191 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMC1P62191 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMC1P62191 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMC1P62191 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMC1P62191 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMC1P62191 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMC1P62191 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms