Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UFM1P61960 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
UFM1P61960 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UFM1P61960 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UFM1P61960 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
UFM1P61960 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UFM1P61960 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UFM1P61960 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UFM1P61960 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
UFM1P61960 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UFM1P61960 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UFM1P61960 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UFM1P61960 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UFM1P61960 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UFM1P61960 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UFM1P61960 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UFM1P61960 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UFM1P61960 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UFM1P61960 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UFM1P61960 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UFM1P61960 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UFM1P61960 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UFM1P61960 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UFM1P61960 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UFM1P61960 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UFM1P61960 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UFM1P61960 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UFM1P61960 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UFM1P61960 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UFM1P61960 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UFM1P61960 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UFM1P61960 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UFM1P61960 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UFM1P61960 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UFM1P61960 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UFM1P61960 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UFM1P61960 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UFM1P61960 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UFM1P61960 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UFM1P61960 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UFM1P61960 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UFM1P61960 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UFM1P61960 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UFM1P61960 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UFM1P61960 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UFM1P61960 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UFM1P61960 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UFM1P61960 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UFM1P61960 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UFM1P61960 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UFM1P61960 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UFM1P61960 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UFM1P61960 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UFM1P61960 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UFM1P61960 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UFM1P61960 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UFM1P61960 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UFM1P61960 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UFM1P61960 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UFM1P61960 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UFM1P61960 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UFM1P61960 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UFM1P61960 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
UFM1P61960 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UFM1P61960 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UFM1P61960 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UFM1P61960 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UFM1P61960 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UFM1P61960 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UFM1P61960 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UFM1P61960 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UFM1P61960 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UFM1P61960 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UFM1P61960 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UFM1P61960 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UFM1P61960 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UFM1P61960 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UFM1P61960 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UFM1P61960 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UFM1P61960 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UFM1P61960 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UFM1P61960 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UFM1P61960 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UFM1P61960 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UFM1P61960 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UFM1P61960 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
UFM1P61960 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
UFM1P61960 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UFM1P61960 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UFM1P61960 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UFM1P61960 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UFM1P61960 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UFM1P61960 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UFM1P61960 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UFM1P61960 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UFM1P61960 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UFM1P61960 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UFM1P61960 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UFM1P61960 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
UFM1P61960 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms