Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNAP25P60880 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNAP25P60880 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNAP25P60880 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNAP25P60880 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNAP25P60880 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SNAP25P60880 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNAP25P60880 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNAP25P60880 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNAP25P60880 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNAP25P60880 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNAP25P60880 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SNAP25P60880 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SNAP25P60880 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNAP25P60880 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNAP25P60880 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNAP25P60880 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SNAP25P60880 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNAP25P60880 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SNAP25P60880 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNAP25P60880 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNAP25P60880 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNAP25P60880 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNAP25P60880 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNAP25P60880 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNAP25P60880 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNAP25P60880 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNAP25P60880 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNAP25P60880 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNAP25P60880 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SNAP25P60880 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNAP25P60880 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNAP25P60880 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNAP25P60880 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNAP25P60880 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNAP25P60880 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNAP25P60880 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SNAP25P60880 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNAP25P60880 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNAP25P60880 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNAP25P60880 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNAP25P60880 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNAP25P60880 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SNAP25P60880 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNAP25P60880 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNAP25P60880 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNAP25P60880 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNAP25P60880 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNAP25P60880 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SNAP25P60880 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SNAP25P60880 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNAP25P60880 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNAP25P60880 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNAP25P60880 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNAP25P60880 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNAP25P60880 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNAP25P60880 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNAP25P60880 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNAP25P60880 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNAP25P60880 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNAP25P60880 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SNAP25P60880 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SNAP25P60880 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNAP25P60880 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNAP25P60880 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNAP25P60880 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNAP25P60880 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNAP25P60880 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNAP25P60880 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SNAP25P60880 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNAP25P60880 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNAP25P60880 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNAP25P60880 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNAP25P60880 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNAP25P60880 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNAP25P60880 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNAP25P60880 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNAP25P60880 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNAP25P60880 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNAP25P60880 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNAP25P60880 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNAP25P60880 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNAP25P60880 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNAP25P60880 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SNAP25P60880 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SNAP25P60880 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNAP25P60880 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNAP25P60880 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNAP25P60880 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SNAP25P60880 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNAP25P60880 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNAP25P60880 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNAP25P60880 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNAP25P60880 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNAP25P60880 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNAP25P60880 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNAP25P60880 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SNAP25P60880 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SNAP25P60880 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNAP25P60880 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms