Protein–RNA interactions for Protein: P60606

CTXN1, Cortexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN1P60606 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTXN1P60606 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTXN1P60606 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTXN1P60606 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTXN1P60606 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTXN1P60606 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTXN1P60606 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CTXN1P60606 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTXN1P60606 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTXN1P60606 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTXN1P60606 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CTXN1P60606 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CTXN1P60606 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CTXN1P60606 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CTXN1P60606 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CTXN1P60606 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTXN1P60606 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTXN1P60606 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTXN1P60606 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTXN1P60606 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CTXN1P60606 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTXN1P60606 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTXN1P60606 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTXN1P60606 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTXN1P60606 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CTXN1P60606 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTXN1P60606 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTXN1P60606 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTXN1P60606 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTXN1P60606 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTXN1P60606 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTXN1P60606 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTXN1P60606 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTXN1P60606 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CTXN1P60606 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTXN1P60606 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTXN1P60606 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTXN1P60606 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTXN1P60606 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTXN1P60606 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTXN1P60606 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTXN1P60606 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTXN1P60606 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTXN1P60606 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTXN1P60606 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTXN1P60606 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTXN1P60606 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTXN1P60606 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTXN1P60606 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTXN1P60606 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTXN1P60606 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTXN1P60606 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTXN1P60606 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTXN1P60606 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTXN1P60606 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTXN1P60606 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CTXN1P60606 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTXN1P60606 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTXN1P60606 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTXN1P60606 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTXN1P60606 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTXN1P60606 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTXN1P60606 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTXN1P60606 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTXN1P60606 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTXN1P60606 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTXN1P60606 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTXN1P60606 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTXN1P60606 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTXN1P60606 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTXN1P60606 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTXN1P60606 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTXN1P60606 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTXN1P60606 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTXN1P60606 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTXN1P60606 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTXN1P60606 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTXN1P60606 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTXN1P60606 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTXN1P60606 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTXN1P60606 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CTXN1P60606 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTXN1P60606 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTXN1P60606 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTXN1P60606 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTXN1P60606 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTXN1P60606 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
CTXN1P60606 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTXN1P60606 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTXN1P60606 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTXN1P60606 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTXN1P60606 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTXN1P60606 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTXN1P60606 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTXN1P60606 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTXN1P60606 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTXN1P60606 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTXN1P60606 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTXN1P60606 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTXN1P60606 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms