Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
RHBDL3P58872 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RHBDL3P58872 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RHBDL3P58872 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RHBDL3P58872 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RHBDL3P58872 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RHBDL3P58872 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RHBDL3P58872 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RHBDL3P58872 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RHBDL3P58872 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RHBDL3P58872 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
RHBDL3P58872 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RHBDL3P58872 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RHBDL3P58872 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RHBDL3P58872 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RHBDL3P58872 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RHBDL3P58872 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RHBDL3P58872 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RHBDL3P58872 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RHBDL3P58872 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RHBDL3P58872 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RHBDL3P58872 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RHBDL3P58872 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RHBDL3P58872 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RHBDL3P58872 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RHBDL3P58872 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RHBDL3P58872 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RHBDL3P58872 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RHBDL3P58872 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RHBDL3P58872 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RHBDL3P58872 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RHBDL3P58872 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RHBDL3P58872 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RHBDL3P58872 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RHBDL3P58872 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RHBDL3P58872 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RHBDL3P58872 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RHBDL3P58872 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RHBDL3P58872 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RHBDL3P58872 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RHBDL3P58872 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RHBDL3P58872 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RHBDL3P58872 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RHBDL3P58872 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RHBDL3P58872 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RHBDL3P58872 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RHBDL3P58872 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RHBDL3P58872 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RHBDL3P58872 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RHBDL3P58872 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RHBDL3P58872 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RHBDL3P58872 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RHBDL3P58872 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RHBDL3P58872 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RHBDL3P58872 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RHBDL3P58872 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RHBDL3P58872 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RHBDL3P58872 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RHBDL3P58872 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
RHBDL3P58872 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
RHBDL3P58872 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
RHBDL3P58872 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RHBDL3P58872 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RHBDL3P58872 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
RHBDL3P58872 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RHBDL3P58872 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RHBDL3P58872 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RHBDL3P58872 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RHBDL3P58872 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RHBDL3P58872 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RHBDL3P58872 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RHBDL3P58872 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RHBDL3P58872 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RHBDL3P58872 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RHBDL3P58872 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RHBDL3P58872 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RHBDL3P58872 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RHBDL3P58872 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RHBDL3P58872 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RHBDL3P58872 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RHBDL3P58872 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RHBDL3P58872 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RHBDL3P58872 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RHBDL3P58872 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RHBDL3P58872 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RHBDL3P58872 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RHBDL3P58872 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RHBDL3P58872 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RHBDL3P58872 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RHBDL3P58872 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RHBDL3P58872 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RHBDL3P58872 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RHBDL3P58872 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RHBDL3P58872 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RHBDL3P58872 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RHBDL3P58872 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RHBDL3P58872 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RHBDL3P58872 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RHBDL3P58872 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RHBDL3P58872 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms