Protein–RNA interactions for Protein: P57739

CLDN2, Claudin-2, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN2P57739 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN2P57739 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN2P57739 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN2P57739 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN2P57739 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN2P57739 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN2P57739 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN2P57739 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN2P57739 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN2P57739 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN2P57739 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN2P57739 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN2P57739 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN2P57739 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN2P57739 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN2P57739 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN2P57739 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN2P57739 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN2P57739 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN2P57739 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN2P57739 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN2P57739 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN2P57739 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN2P57739 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN2P57739 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN2P57739 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN2P57739 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN2P57739 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN2P57739 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN2P57739 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN2P57739 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN2P57739 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN2P57739 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN2P57739 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN2P57739 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN2P57739 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN2P57739 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN2P57739 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN2P57739 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN2P57739 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN2P57739 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN2P57739 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN2P57739 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN2P57739 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN2P57739 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN2P57739 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN2P57739 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN2P57739 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN2P57739 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN2P57739 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN2P57739 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN2P57739 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN2P57739 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN2P57739 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN2P57739 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN2P57739 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN2P57739 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN2P57739 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN2P57739 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN2P57739 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN2P57739 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN2P57739 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN2P57739 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN2P57739 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN2P57739 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN2P57739 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN2P57739 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN2P57739 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN2P57739 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN2P57739 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN2P57739 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN2P57739 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN2P57739 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN2P57739 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN2P57739 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN2P57739 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN2P57739 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN2P57739 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN2P57739 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN2P57739 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN2P57739 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN2P57739 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN2P57739 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN2P57739 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN2P57739 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN2P57739 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN2P57739 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN2P57739 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN2P57739 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN2P57739 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN2P57739 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN2P57739 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN2P57739 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN2P57739 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN2P57739 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN2P57739 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN2P57739 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN2P57739 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN2P57739 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN2P57739 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms