Protein–RNA interactions for Protein: P57729

RAB38, Ras-related protein Rab-38, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB38P57729 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB38P57729 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB38P57729 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB38P57729 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB38P57729 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB38P57729 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB38P57729 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB38P57729 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB38P57729 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB38P57729 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB38P57729 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB38P57729 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB38P57729 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB38P57729 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB38P57729 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB38P57729 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB38P57729 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB38P57729 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB38P57729 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB38P57729 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB38P57729 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB38P57729 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB38P57729 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB38P57729 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB38P57729 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB38P57729 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB38P57729 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB38P57729 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB38P57729 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB38P57729 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB38P57729 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB38P57729 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB38P57729 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB38P57729 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB38P57729 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB38P57729 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB38P57729 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB38P57729 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB38P57729 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB38P57729 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB38P57729 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB38P57729 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB38P57729 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB38P57729 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB38P57729 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB38P57729 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB38P57729 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB38P57729 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB38P57729 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RAB38P57729 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
RAB38P57729 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RAB38P57729 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB38P57729 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB38P57729 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB38P57729 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB38P57729 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB38P57729 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB38P57729 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB38P57729 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB38P57729 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB38P57729 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB38P57729 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB38P57729 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB38P57729 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB38P57729 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB38P57729 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB38P57729 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB38P57729 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB38P57729 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB38P57729 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB38P57729 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB38P57729 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB38P57729 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB38P57729 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB38P57729 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB38P57729 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB38P57729 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB38P57729 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB38P57729 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB38P57729 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB38P57729 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB38P57729 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB38P57729 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RAB38P57729 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB38P57729 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB38P57729 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB38P57729 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB38P57729 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB38P57729 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB38P57729 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB38P57729 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB38P57729 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB38P57729 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB38P57729 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB38P57729 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB38P57729 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB38P57729 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB38P57729 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB38P57729 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB38P57729 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms