Protein–RNA interactions for Protein: P56704

WNT3A, Protein Wnt-3a, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WNT3AP56704 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
WNT3AP56704 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
WNT3AP56704 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
WNT3AP56704 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
WNT3AP56704 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
WNT3AP56704 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
WNT3AP56704 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
WNT3AP56704 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
WNT3AP56704 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
WNT3AP56704 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
WNT3AP56704 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
WNT3AP56704 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
WNT3AP56704 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
WNT3AP56704 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
WNT3AP56704 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
WNT3AP56704 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
WNT3AP56704 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
WNT3AP56704 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
WNT3AP56704 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
WNT3AP56704 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
WNT3AP56704 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
WNT3AP56704 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
WNT3AP56704 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
WNT3AP56704 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
WNT3AP56704 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
WNT3AP56704 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
WNT3AP56704 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
WNT3AP56704 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
WNT3AP56704 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
WNT3AP56704 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
WNT3AP56704 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
WNT3AP56704 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
WNT3AP56704 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
WNT3AP56704 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
WNT3AP56704 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
WNT3AP56704 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
WNT3AP56704 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
WNT3AP56704 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
WNT3AP56704 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
WNT3AP56704 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
WNT3AP56704 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
WNT3AP56704 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
WNT3AP56704 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
WNT3AP56704 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
WNT3AP56704 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
WNT3AP56704 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
WNT3AP56704 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
WNT3AP56704 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
WNT3AP56704 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
WNT3AP56704 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
WNT3AP56704 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
WNT3AP56704 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
WNT3AP56704 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
WNT3AP56704 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
WNT3AP56704 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
WNT3AP56704 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
WNT3AP56704 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
WNT3AP56704 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
WNT3AP56704 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
WNT3AP56704 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
WNT3AP56704 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
WNT3AP56704 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
WNT3AP56704 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
WNT3AP56704 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
WNT3AP56704 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
WNT3AP56704 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
WNT3AP56704 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
WNT3AP56704 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
WNT3AP56704 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
WNT3AP56704 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
WNT3AP56704 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
WNT3AP56704 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
WNT3AP56704 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
WNT3AP56704 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
WNT3AP56704 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
WNT3AP56704 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
WNT3AP56704 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
WNT3AP56704 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
WNT3AP56704 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
WNT3AP56704 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
WNT3AP56704 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
WNT3AP56704 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
WNT3AP56704 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
WNT3AP56704 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
WNT3AP56704 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
WNT3AP56704 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
WNT3AP56704 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
WNT3AP56704 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
WNT3AP56704 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
WNT3AP56704 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
WNT3AP56704 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
WNT3AP56704 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
WNT3AP56704 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
WNT3AP56704 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
WNT3AP56704 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
WNT3AP56704 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
WNT3AP56704 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
WNT3AP56704 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
WNT3AP56704 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
WNT3AP56704 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms