Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NME5P56597 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NME5P56597 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NME5P56597 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NME5P56597 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NME5P56597 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NME5P56597 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NME5P56597 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NME5P56597 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NME5P56597 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NME5P56597 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NME5P56597 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NME5P56597 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NME5P56597 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NME5P56597 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NME5P56597 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NME5P56597 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NME5P56597 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NME5P56597 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NME5P56597 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NME5P56597 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NME5P56597 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NME5P56597 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NME5P56597 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NME5P56597 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NME5P56597 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NME5P56597 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NME5P56597 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NME5P56597 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NME5P56597 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NME5P56597 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NME5P56597 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NME5P56597 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NME5P56597 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NME5P56597 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NME5P56597 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NME5P56597 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME5P56597 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME5P56597 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME5P56597 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME5P56597 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME5P56597 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME5P56597 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME5P56597 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME5P56597 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME5P56597 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NME5P56597 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NME5P56597 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NME5P56597 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NME5P56597 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NME5P56597 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NME5P56597 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NME5P56597 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NME5P56597 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NME5P56597 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NME5P56597 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NME5P56597 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NME5P56597 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NME5P56597 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NME5P56597 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NME5P56597 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NME5P56597 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NME5P56597 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NME5P56597 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NME5P56597 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NME5P56597 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NME5P56597 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NME5P56597 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NME5P56597 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NME5P56597 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NME5P56597 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NME5P56597 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NME5P56597 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NME5P56597 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NME5P56597 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NME5P56597 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NME5P56597 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NME5P56597 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NME5P56597 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NME5P56597 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NME5P56597 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NME5P56597 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NME5P56597 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NME5P56597 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NME5P56597 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NME5P56597 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NME5P56597 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NME5P56597 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NME5P56597 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NME5P56597 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NME5P56597 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NME5P56597 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NME5P56597 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NME5P56597 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NME5P56597 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NME5P56597 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NME5P56597 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NME5P56597 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NME5P56597 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NME5P56597 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms