Protein–RNA interactions for Protein: P55771

PAX9, Paired box protein Pax-9, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX9P55771 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAX9P55771 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAX9P55771 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAX9P55771 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAX9P55771 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAX9P55771 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAX9P55771 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAX9P55771 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAX9P55771 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAX9P55771 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PAX9P55771 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAX9P55771 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAX9P55771 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAX9P55771 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAX9P55771 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAX9P55771 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAX9P55771 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAX9P55771 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAX9P55771 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAX9P55771 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAX9P55771 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAX9P55771 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAX9P55771 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAX9P55771 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PAX9P55771 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAX9P55771 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAX9P55771 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAX9P55771 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAX9P55771 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAX9P55771 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAX9P55771 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAX9P55771 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAX9P55771 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAX9P55771 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAX9P55771 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAX9P55771 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAX9P55771 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAX9P55771 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAX9P55771 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAX9P55771 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAX9P55771 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAX9P55771 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAX9P55771 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAX9P55771 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAX9P55771 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAX9P55771 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAX9P55771 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAX9P55771 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAX9P55771 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAX9P55771 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAX9P55771 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAX9P55771 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAX9P55771 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAX9P55771 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAX9P55771 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAX9P55771 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PAX9P55771 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAX9P55771 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PAX9P55771 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAX9P55771 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAX9P55771 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAX9P55771 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAX9P55771 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAX9P55771 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAX9P55771 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAX9P55771 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAX9P55771 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAX9P55771 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAX9P55771 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAX9P55771 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAX9P55771 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAX9P55771 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAX9P55771 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAX9P55771 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAX9P55771 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAX9P55771 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAX9P55771 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAX9P55771 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAX9P55771 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAX9P55771 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAX9P55771 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAX9P55771 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAX9P55771 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAX9P55771 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAX9P55771 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAX9P55771 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAX9P55771 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAX9P55771 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAX9P55771 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAX9P55771 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAX9P55771 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAX9P55771 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAX9P55771 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAX9P55771 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAX9P55771 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAX9P55771 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAX9P55771 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAX9P55771 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAX9P55771 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAX9P55771 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms