Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ELLP55199 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ELLP55199 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ELLP55199 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ELLP55199 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ELLP55199 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ELLP55199 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ELLP55199 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ELLP55199 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ELLP55199 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ELLP55199 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ELLP55199 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ELLP55199 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ELLP55199 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ELLP55199 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ELLP55199 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ELLP55199 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ELLP55199 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ELLP55199 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ELLP55199 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ELLP55199 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ELLP55199 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ELLP55199 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ELLP55199 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ELLP55199 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ELLP55199 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ELLP55199 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ELLP55199 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ELLP55199 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ELLP55199 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ELLP55199 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ELLP55199 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ELLP55199 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ELLP55199 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ELLP55199 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ELLP55199 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ELLP55199 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ELLP55199 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ELLP55199 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ELLP55199 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ELLP55199 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ELLP55199 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ELLP55199 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ELLP55199 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ELLP55199 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ELLP55199 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ELLP55199 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ELLP55199 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ELLP55199 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ELLP55199 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ELLP55199 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ELLP55199 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ELLP55199 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ELLP55199 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ELLP55199 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ELLP55199 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ELLP55199 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ELLP55199 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ELLP55199 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ELLP55199 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ELLP55199 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ELLP55199 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ELLP55199 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ELLP55199 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ELLP55199 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ELLP55199 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ELLP55199 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ELLP55199 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ELLP55199 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ELLP55199 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ELLP55199 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ELLP55199 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ELLP55199 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ELLP55199 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ELLP55199 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ELLP55199 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ELLP55199 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ELLP55199 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ELLP55199 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ELLP55199 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ELLP55199 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ELLP55199 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ELLP55199 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ELLP55199 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ELLP55199 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ELLP55199 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ELLP55199 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ELLP55199 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ELLP55199 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ELLP55199 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ELLP55199 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ELLP55199 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ELLP55199 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ELLP55199 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ELLP55199 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ELLP55199 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ELLP55199 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ELLP55199 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ELLP55199 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ELLP55199 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms