Protein–RNA interactions for Protein: P55082

MFAP3, Microfibril-associated glycoprotein 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFAP3P55082 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MFAP3P55082 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MFAP3P55082 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MFAP3P55082 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MFAP3P55082 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MFAP3P55082 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MFAP3P55082 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MFAP3P55082 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MFAP3P55082 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MFAP3P55082 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MFAP3P55082 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MFAP3P55082 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MFAP3P55082 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MFAP3P55082 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MFAP3P55082 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MFAP3P55082 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MFAP3P55082 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MFAP3P55082 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MFAP3P55082 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MFAP3P55082 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MFAP3P55082 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MFAP3P55082 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MFAP3P55082 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MFAP3P55082 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MFAP3P55082 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MFAP3P55082 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MFAP3P55082 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MFAP3P55082 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MFAP3P55082 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MFAP3P55082 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MFAP3P55082 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MFAP3P55082 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MFAP3P55082 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MFAP3P55082 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MFAP3P55082 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MFAP3P55082 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MFAP3P55082 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MFAP3P55082 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MFAP3P55082 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MFAP3P55082 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MFAP3P55082 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MFAP3P55082 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MFAP3P55082 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MFAP3P55082 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MFAP3P55082 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MFAP3P55082 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MFAP3P55082 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MFAP3P55082 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MFAP3P55082 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MFAP3P55082 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MFAP3P55082 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MFAP3P55082 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MFAP3P55082 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MFAP3P55082 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MFAP3P55082 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MFAP3P55082 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MFAP3P55082 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MFAP3P55082 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MFAP3P55082 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MFAP3P55082 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MFAP3P55082 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MFAP3P55082 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MFAP3P55082 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MFAP3P55082 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MFAP3P55082 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MFAP3P55082 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MFAP3P55082 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MFAP3P55082 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MFAP3P55082 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MFAP3P55082 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MFAP3P55082 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MFAP3P55082 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MFAP3P55082 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MFAP3P55082 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MFAP3P55082 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MFAP3P55082 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MFAP3P55082 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MFAP3P55082 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MFAP3P55082 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MFAP3P55082 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MFAP3P55082 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MFAP3P55082 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MFAP3P55082 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MFAP3P55082 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MFAP3P55082 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MFAP3P55082 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MFAP3P55082 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MFAP3P55082 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MFAP3P55082 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MFAP3P55082 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MFAP3P55082 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MFAP3P55082 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MFAP3P55082 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MFAP3P55082 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MFAP3P55082 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MFAP3P55082 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MFAP3P55082 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MFAP3P55082 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MFAP3P55082 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MFAP3P55082 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms