Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EPHB4P54760 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EPHB4P54760 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EPHB4P54760 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EPHB4P54760 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EPHB4P54760 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EPHB4P54760 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
EPHB4P54760 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EPHB4P54760 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EPHB4P54760 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EPHB4P54760 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EPHB4P54760 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EPHB4P54760 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EPHB4P54760 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EPHB4P54760 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EPHB4P54760 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EPHB4P54760 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EPHB4P54760 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EPHB4P54760 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EPHB4P54760 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
EPHB4P54760 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
EPHB4P54760 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPHB4P54760 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPHB4P54760 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPHB4P54760 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPHB4P54760 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPHB4P54760 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPHB4P54760 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPHB4P54760 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPHB4P54760 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPHB4P54760 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPHB4P54760 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPHB4P54760 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPHB4P54760 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
EPHB4P54760 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPHB4P54760 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPHB4P54760 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
EPHB4P54760 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPHB4P54760 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPHB4P54760 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPHB4P54760 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPHB4P54760 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPHB4P54760 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EPHB4P54760 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EPHB4P54760 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EPHB4P54760 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
EPHB4P54760 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EPHB4P54760 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EPHB4P54760 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EPHB4P54760 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EPHB4P54760 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EPHB4P54760 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EPHB4P54760 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EPHB4P54760 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EPHB4P54760 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EPHB4P54760 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EPHB4P54760 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EPHB4P54760 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EPHB4P54760 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EPHB4P54760 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
EPHB4P54760 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EPHB4P54760 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EPHB4P54760 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EPHB4P54760 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
EPHB4P54760 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EPHB4P54760 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EPHB4P54760 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EPHB4P54760 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EPHB4P54760 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EPHB4P54760 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EPHB4P54760 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EPHB4P54760 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EPHB4P54760 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EPHB4P54760 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EPHB4P54760 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EPHB4P54760 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EPHB4P54760 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EPHB4P54760 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EPHB4P54760 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
EPHB4P54760 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EPHB4P54760 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EPHB4P54760 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EPHB4P54760 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EPHB4P54760 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
EPHB4P54760 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EPHB4P54760 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EPHB4P54760 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EPHB4P54760 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
EPHB4P54760 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EPHB4P54760 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EPHB4P54760 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
EPHB4P54760 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
EPHB4P54760 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EPHB4P54760 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EPHB4P54760 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EPHB4P54760 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EPHB4P54760 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EPHB4P54760 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EPHB4P54760 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EPHB4P54760 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms