Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP12AP54707 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP12AP54707 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP12AP54707 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP12AP54707 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP12AP54707 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP12AP54707 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP12AP54707 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP12AP54707 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP12AP54707 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP12AP54707 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP12AP54707 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP12AP54707 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP12AP54707 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP12AP54707 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP12AP54707 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP12AP54707 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP12AP54707 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP12AP54707 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP12AP54707 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP12AP54707 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP12AP54707 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP12AP54707 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP12AP54707 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP12AP54707 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP12AP54707 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP12AP54707 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP12AP54707 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP12AP54707 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP12AP54707 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP12AP54707 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP12AP54707 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP12AP54707 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP12AP54707 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP12AP54707 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP12AP54707 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP12AP54707 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP12AP54707 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP12AP54707 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms