Protein–RNA interactions for Protein: P54252

ATXN3, Ataxin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3P54252 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATXN3P54252 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATXN3P54252 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATXN3P54252 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATXN3P54252 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATXN3P54252 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ATXN3P54252 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATXN3P54252 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATXN3P54252 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATXN3P54252 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATXN3P54252 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATXN3P54252 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATXN3P54252 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATXN3P54252 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATXN3P54252 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATXN3P54252 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATXN3P54252 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATXN3P54252 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATXN3P54252 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATXN3P54252 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATXN3P54252 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATXN3P54252 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATXN3P54252 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ATXN3P54252 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATXN3P54252 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATXN3P54252 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATXN3P54252 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATXN3P54252 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATXN3P54252 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATXN3P54252 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATXN3P54252 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATXN3P54252 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATXN3P54252 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATXN3P54252 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATXN3P54252 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATXN3P54252 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATXN3P54252 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ATXN3P54252 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATXN3P54252 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATXN3P54252 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATXN3P54252 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATXN3P54252 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATXN3P54252 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATXN3P54252 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATXN3P54252 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATXN3P54252 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATXN3P54252 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATXN3P54252 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATXN3P54252 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATXN3P54252 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATXN3P54252 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATXN3P54252 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATXN3P54252 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATXN3P54252 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATXN3P54252 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATXN3P54252 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATXN3P54252 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATXN3P54252 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATXN3P54252 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATXN3P54252 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATXN3P54252 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATXN3P54252 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATXN3P54252 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATXN3P54252 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATXN3P54252 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ATXN3P54252 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATXN3P54252 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ATXN3P54252 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATXN3P54252 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ATXN3P54252 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATXN3P54252 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATXN3P54252 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATXN3P54252 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATXN3P54252 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATXN3P54252 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ATXN3P54252 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATXN3P54252 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATXN3P54252 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATXN3P54252 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATXN3P54252 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATXN3P54252 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATXN3P54252 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATXN3P54252 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATXN3P54252 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATXN3P54252 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATXN3P54252 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATXN3P54252 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATXN3P54252 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATXN3P54252 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATXN3P54252 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATXN3P54252 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATXN3P54252 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATXN3P54252 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATXN3P54252 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATXN3P54252 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATXN3P54252 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ATXN3P54252 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATXN3P54252 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATXN3P54252 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ATXN3P54252 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms