Protein–RNA interactions for Protein: P54105

CLNS1A, Methylosome subunit pICln, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNS1AP54105 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLNS1AP54105 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLNS1AP54105 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLNS1AP54105 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLNS1AP54105 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLNS1AP54105 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLNS1AP54105 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLNS1AP54105 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLNS1AP54105 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLNS1AP54105 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLNS1AP54105 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLNS1AP54105 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLNS1AP54105 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLNS1AP54105 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLNS1AP54105 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLNS1AP54105 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLNS1AP54105 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLNS1AP54105 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLNS1AP54105 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLNS1AP54105 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLNS1AP54105 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLNS1AP54105 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLNS1AP54105 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLNS1AP54105 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLNS1AP54105 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLNS1AP54105 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLNS1AP54105 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLNS1AP54105 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLNS1AP54105 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLNS1AP54105 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLNS1AP54105 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLNS1AP54105 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLNS1AP54105 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLNS1AP54105 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLNS1AP54105 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLNS1AP54105 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLNS1AP54105 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLNS1AP54105 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLNS1AP54105 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLNS1AP54105 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLNS1AP54105 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLNS1AP54105 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CLNS1AP54105 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CLNS1AP54105 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLNS1AP54105 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLNS1AP54105 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLNS1AP54105 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLNS1AP54105 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLNS1AP54105 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLNS1AP54105 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLNS1AP54105 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLNS1AP54105 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLNS1AP54105 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLNS1AP54105 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLNS1AP54105 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLNS1AP54105 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLNS1AP54105 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLNS1AP54105 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLNS1AP54105 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLNS1AP54105 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLNS1AP54105 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLNS1AP54105 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLNS1AP54105 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLNS1AP54105 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLNS1AP54105 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLNS1AP54105 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLNS1AP54105 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLNS1AP54105 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CLNS1AP54105 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CLNS1AP54105 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLNS1AP54105 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLNS1AP54105 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLNS1AP54105 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLNS1AP54105 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLNS1AP54105 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CLNS1AP54105 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLNS1AP54105 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLNS1AP54105 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLNS1AP54105 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLNS1AP54105 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLNS1AP54105 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CLNS1AP54105 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLNS1AP54105 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLNS1AP54105 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLNS1AP54105 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLNS1AP54105 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLNS1AP54105 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLNS1AP54105 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLNS1AP54105 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLNS1AP54105 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLNS1AP54105 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLNS1AP54105 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLNS1AP54105 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLNS1AP54105 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLNS1AP54105 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLNS1AP54105 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLNS1AP54105 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLNS1AP54105 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLNS1AP54105 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLNS1AP54105 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms