Protein–RNA interactions for Protein: P53803

POLR2K, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2KP53803 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2KP53803 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2KP53803 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2KP53803 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2KP53803 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2KP53803 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2KP53803 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2KP53803 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2KP53803 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2KP53803 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2KP53803 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2KP53803 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2KP53803 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2KP53803 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2KP53803 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2KP53803 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2KP53803 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2KP53803 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2KP53803 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2KP53803 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2KP53803 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2KP53803 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2KP53803 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2KP53803 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2KP53803 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2KP53803 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2KP53803 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2KP53803 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2KP53803 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2KP53803 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2KP53803 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2KP53803 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2KP53803 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2KP53803 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2KP53803 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2KP53803 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2KP53803 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2KP53803 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2KP53803 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2KP53803 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2KP53803 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2KP53803 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2KP53803 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2KP53803 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2KP53803 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2KP53803 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2KP53803 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2KP53803 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2KP53803 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2KP53803 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2KP53803 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2KP53803 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2KP53803 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2KP53803 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2KP53803 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2KP53803 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2KP53803 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2KP53803 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2KP53803 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2KP53803 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2KP53803 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2KP53803 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2KP53803 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2KP53803 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2KP53803 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2KP53803 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2KP53803 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2KP53803 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2KP53803 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2KP53803 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2KP53803 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2KP53803 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2KP53803 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2KP53803 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 888.4 ms