Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
AP2S1P53680 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms