Protein–RNA interactions for Protein: P53671

LIMK2, LIM domain kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK2P53671 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LIMK2P53671 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LIMK2P53671 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LIMK2P53671 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LIMK2P53671 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LIMK2P53671 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LIMK2P53671 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LIMK2P53671 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LIMK2P53671 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LIMK2P53671 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LIMK2P53671 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LIMK2P53671 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LIMK2P53671 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LIMK2P53671 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LIMK2P53671 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LIMK2P53671 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LIMK2P53671 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LIMK2P53671 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIMK2P53671 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIMK2P53671 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIMK2P53671 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIMK2P53671 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIMK2P53671 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIMK2P53671 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIMK2P53671 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIMK2P53671 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LIMK2P53671 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LIMK2P53671 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LIMK2P53671 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LIMK2P53671 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LIMK2P53671 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LIMK2P53671 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LIMK2P53671 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LIMK2P53671 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LIMK2P53671 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LIMK2P53671 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LIMK2P53671 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LIMK2P53671 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LIMK2P53671 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LIMK2P53671 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LIMK2P53671 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LIMK2P53671 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LIMK2P53671 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LIMK2P53671 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LIMK2P53671 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LIMK2P53671 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LIMK2P53671 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LIMK2P53671 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LIMK2P53671 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LIMK2P53671 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIMK2P53671 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIMK2P53671 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIMK2P53671 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIMK2P53671 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIMK2P53671 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIMK2P53671 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIMK2P53671 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIMK2P53671 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIMK2P53671 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIMK2P53671 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIMK2P53671 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIMK2P53671 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIMK2P53671 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIMK2P53671 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIMK2P53671 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LIMK2P53671 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIMK2P53671 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIMK2P53671 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIMK2P53671 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIMK2P53671 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIMK2P53671 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIMK2P53671 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIMK2P53671 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIMK2P53671 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIMK2P53671 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIMK2P53671 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIMK2P53671 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIMK2P53671 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIMK2P53671 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIMK2P53671 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LIMK2P53671 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIMK2P53671 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIMK2P53671 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIMK2P53671 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIMK2P53671 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIMK2P53671 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIMK2P53671 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIMK2P53671 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIMK2P53671 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIMK2P53671 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LIMK2P53671 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIMK2P53671 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIMK2P53671 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIMK2P53671 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIMK2P53671 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIMK2P53671 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIMK2P53671 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIMK2P53671 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIMK2P53671 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIMK2P53671 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms