Protein–RNA interactions for Protein: P53599

SSK2, MAP kinase kinase kinase SSK2, yeastyeast

Predictions only

Length 1,579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSK2P53599 SLX1YBR228W 915 nt6.77□□□□□ -1.33
SSK2P53599 PAL1YDR348C 1500 nt6.76□□□□□ -1.33
SSK2P53599 AAD6YFL056C 639 nt6.76□□□□□ -1.33
SSK2P53599 HEK2YBL032W 1146 nt6.76□□□□□ -1.33
SSK2P53599 VHT1YGR065C 1782 nt6.76□□□□□ -1.33
SSK2P53599 MET17YLR303W 1335 nt6.75□□□□□ -1.33
SSK2P53599 YHR032C-AYHR032C-A 120 nt6.75□□□□□ -1.33
SSK2P53599 PGM2YMR105C 1710 nt6.75□□□□□ -1.33
SSK2P53599 BAT2YJR148W 1131 nt6.74□□□□□ -1.33
SSK2P53599 RDN5-1RDN5-1 121 nt6.74□□□□□ -1.33
SSK2P53599 SEC72YLR292C 582 nt6.74□□□□□ -1.33
SSK2P53599 RDN5-6RDN5-6 121 nt6.74□□□□□ -1.33
SSK2P53599 EOS1YNL080C 1101 nt6.74□□□□□ -1.33
SSK2P53599 RFA2YNL312W 822 nt6.74□□□□□ -1.33
SSK2P53599 PEP5YMR231W 3090 nt6.74□□□□□ -1.33
SSK2P53599 PDR15YDR406W 4590 nt6.74□□□□□ -1.33
SSK2P53599 ENP1YBR247C 1452 nt6.74□□□□□ -1.33
SSK2P53599 ATF1YOR377W 1578 nt6.74□□□□□ -1.33
SSK2P53599 HNT2YDR305C 654 nt6.74□□□□□ -1.33
SSK2P53599 ILV5YLR355C 1188 nt6.74□□□□□ -1.33
SSK2P53599 RAD16YBR114W 2373 nt6.73□□□□□ -1.33
SSK2P53599 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt6.73□□□□□ -1.33
SSK2P53599 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt6.73□□□□□ -1.33
SSK2P53599 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt6.73□□□□□ -1.33
SSK2P53599 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt6.73□□□□□ -1.33
SSK2P53599 MSW1YDR268W 1140 nt6.73□□□□□ -1.33
SSK2P53599 CRT10YOL063C 2874 nt6.72□□□□□ -1.33
SSK2P53599 DBP9YLR276C 1785 nt6.72□□□□□ -1.33
SSK2P53599 YGR127WYGR127W 939 nt6.72□□□□□ -1.33
SSK2P53599 snR17bsnR17b 332 nt6.72□□□□□ -1.33
SSK2P53599 MNT2YGL257C 1677 nt6.72□□□□□ -1.33
SSK2P53599 CYC8YBR112C 2901 nt6.72□□□□□ -1.33
SSK2P53599 GTT2YLL060C 702 nt6.71□□□□□ -1.34
SSK2P53599 IMP1YMR150C 573 nt6.71□□□□□ -1.34
SSK2P53599 HXK2YGL253W 1461 nt6.71□□□□□ -1.34
SSK2P53599 YLR446WYLR446W 1302 nt6.71□□□□□ -1.34
SSK2P53599 YJL206CYJL206C 2277 nt6.71□□□□□ -1.34
SSK2P53599 IMA3YIL172C 1770 nt6.7□□□□□ -1.34
SSK2P53599 IMA4YJL221C 1770 nt6.7□□□□□ -1.34
SSK2P53599 PER1YCR044C 1074 nt6.7□□□□□ -1.34
SSK2P53599 YIL021C-AYIL021C-A 270 nt6.7□□□□□ -1.34
SSK2P53599 CDC42YLR229C 576 nt6.7□□□□□ -1.34
SSK2P53599 CDC48YDL126C 2508 nt6.7□□□□□ -1.34
SSK2P53599 PTC1YDL006W 846 nt6.69□□□□□ -1.34
SSK2P53599 RNA15YGL044C 891 nt6.69□□□□□ -1.34
SSK2P53599 RAD4YER162C 2265 nt6.69□□□□□ -1.34
SSK2P53599 RAD52YML032C 1416 nt6.69□□□□□ -1.34
SSK2P53599 SLA1YBL007C 3735 nt6.68□□□□□ -1.34
SSK2P53599 YGL199CYGL199C 471 nt6.68□□□□□ -1.34
SSK2P53599 YJR112W-AYJR112W-A 330 nt6.68□□□□□ -1.34
SSK2P53599 EAR1YMR171C 1653 nt6.67□□□□□ -1.34
SSK2P53599 TRP1YDR007W 675 nt6.67□□□□□ -1.34
SSK2P53599 YBR219CYBR219C 384 nt6.67□□□□□ -1.34
SSK2P53599 EUG1YDR518W 1554 nt6.66□□□□□ -1.34
SSK2P53599 NUP42YDR192C 1293 nt6.66□□□□□ -1.34
SSK2P53599 SGN1YIR001C 753 nt6.66□□□□□ -1.34
SSK2P53599 ERP2YAL007C 648 nt6.66□□□□□ -1.34
SSK2P53599 snR7-SsnR7-S 179 nt6.65□□□□□ -1.34
SSK2P53599 AHA1YDR214W 1053 nt6.65□□□□□ -1.34
SSK2P53599 BUD13YGL174W 801 nt6.65□□□□□ -1.34
SSK2P53599 HSP150YJL159W 1242 nt6.65□□□□□ -1.34
SSK2P53599 YBR053CYBR053C 1077 nt6.65□□□□□ -1.34
SSK2P53599 CCZ1YBR131W 2115 nt6.65□□□□□ -1.34
SSK2P53599 MPS3YJL019W 2049 nt6.65□□□□□ -1.35
SSK2P53599 MRP4YHL004W 1185 nt6.65□□□□□ -1.35
SSK2P53599 VPS30YPL120W 1674 nt6.64□□□□□ -1.35
SSK2P53599 YEL020CYEL020C 1683 nt6.63□□□□□ -1.35
SSK2P53599 YDL071CYDL071C 375 nt6.63□□□□□ -1.35
SSK2P53599 YIL171WYIL171W 330 nt6.63□□□□□ -1.35
SSK2P53599 YDC1YPL087W 954 nt6.63□□□□□ -1.35
SSK2P53599 ECM33YBR078W 1290 nt6.63□□□□□ -1.35
SSK2P53599 PAH1YMR165C 2589 nt6.63□□□□□ -1.35
SSK2P53599 SEC2YNL272C 2280 nt6.63□□□□□ -1.35
SSK2P53599 LAS1YKR063C 1509 nt6.63□□□□□ -1.35
SSK2P53599 LHP1YDL051W 828 nt6.62□□□□□ -1.35
SSK2P53599 YDR391CYDR391C 699 nt6.62□□□□□ -1.35
SSK2P53599 RPS0AYGR214W 759 nt6.62□□□□□ -1.35
SSK2P53599 RSF2YJR127C 4143 nt6.62□□□□□ -1.35
SSK2P53599 DNF2YDR093W 4839 nt6.62□□□□□ -1.35
SSK2P53599 YDR193WYDR193W 399 nt6.61□□□□□ -1.35
SSK2P53599 HIS6YIL020C 786 nt6.61□□□□□ -1.35
SSK2P53599 YLR296WYLR296W 327 nt6.61□□□□□ -1.35
SSK2P53599 HLJ1YMR161W 675 nt6.61□□□□□ -1.35
SSK2P53599 SUA7YPR086W 1038 nt6.61□□□□□ -1.35
SSK2P53599 ZRT1YGL255W 1131 nt6.61□□□□□ -1.35
SSK2P53599 LSB1YGR136W 726 nt6.61□□□□□ -1.35
SSK2P53599 TVP38YKR088C 1014 nt6.61□□□□□ -1.35
SSK2P53599 FAR8YMR029C 1572 nt6.61□□□□□ -1.35
SSK2P53599 SIR2YDL042C 1689 nt6.6□□□□□ -1.35
SSK2P53599 IES6YEL044W 501 nt6.6□□□□□ -1.35
SSK2P53599 YGL185CYGL185C 1140 nt6.6□□□□□ -1.35
SSK2P53599 GVP36YIL041W 981 nt6.59□□□□□ -1.35
SSK2P53599 SDS3YIL084C 984 nt6.59□□□□□ -1.35
SSK2P53599 USA1YML029W 2517 nt6.59□□□□□ -1.35
SSK2P53599 HXT17YNR072W 1695 nt6.59□□□□□ -1.35
SSK2P53599 AXL2YIL140W 2472 nt6.58□□□□□ -1.36
SSK2P53599 MST1YKL194C 1389 nt6.58□□□□□ -1.36
SSK2P53599 TRF5YNL299W 1929 nt6.57□□□□□ -1.36
SSK2P53599 TFB3YDR460W 966 nt6.57□□□□□ -1.36
SSK2P53599 RAD27YKL113C 1149 nt6.57□□□□□ -1.36
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