Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARFIP1P53367 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARFIP1P53367 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARFIP1P53367 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARFIP1P53367 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARFIP1P53367 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARFIP1P53367 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARFIP1P53367 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ARFIP1P53367 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARFIP1P53367 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARFIP1P53367 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARFIP1P53367 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARFIP1P53367 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARFIP1P53367 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARFIP1P53367 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARFIP1P53367 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARFIP1P53367 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARFIP1P53367 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARFIP1P53367 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARFIP1P53367 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARFIP1P53367 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARFIP1P53367 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ARFIP1P53367 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARFIP1P53367 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARFIP1P53367 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARFIP1P53367 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARFIP1P53367 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARFIP1P53367 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARFIP1P53367 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARFIP1P53367 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARFIP1P53367 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARFIP1P53367 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ARFIP1P53367 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARFIP1P53367 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARFIP1P53367 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARFIP1P53367 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARFIP1P53367 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARFIP1P53367 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARFIP1P53367 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ARFIP1P53367 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARFIP1P53367 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARFIP1P53367 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARFIP1P53367 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARFIP1P53367 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARFIP1P53367 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARFIP1P53367 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ARFIP1P53367 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARFIP1P53367 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARFIP1P53367 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARFIP1P53367 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARFIP1P53367 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARFIP1P53367 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARFIP1P53367 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARFIP1P53367 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARFIP1P53367 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARFIP1P53367 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ARFIP1P53367 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARFIP1P53367 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARFIP1P53367 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARFIP1P53367 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARFIP1P53367 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARFIP1P53367 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARFIP1P53367 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARFIP1P53367 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARFIP1P53367 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARFIP1P53367 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARFIP1P53367 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARFIP1P53367 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARFIP1P53367 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARFIP1P53367 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARFIP1P53367 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARFIP1P53367 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARFIP1P53367 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARFIP1P53367 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARFIP1P53367 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARFIP1P53367 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARFIP1P53367 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARFIP1P53367 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARFIP1P53367 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARFIP1P53367 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARFIP1P53367 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARFIP1P53367 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARFIP1P53367 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARFIP1P53367 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARFIP1P53367 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARFIP1P53367 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARFIP1P53367 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARFIP1P53367 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARFIP1P53367 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARFIP1P53367 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARFIP1P53367 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARFIP1P53367 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARFIP1P53367 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARFIP1P53367 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARFIP1P53367 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARFIP1P53367 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARFIP1P53367 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARFIP1P53367 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARFIP1P53367 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARFIP1P53367 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms