Protein–RNA interactions for Protein: P52735

VAV2, Guanine nucleotide exchange factor VAV2, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV2P52735 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VAV2P52735 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VAV2P52735 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VAV2P52735 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VAV2P52735 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VAV2P52735 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VAV2P52735 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VAV2P52735 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VAV2P52735 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VAV2P52735 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VAV2P52735 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VAV2P52735 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VAV2P52735 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VAV2P52735 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VAV2P52735 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VAV2P52735 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VAV2P52735 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VAV2P52735 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VAV2P52735 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VAV2P52735 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VAV2P52735 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VAV2P52735 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VAV2P52735 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VAV2P52735 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VAV2P52735 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VAV2P52735 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VAV2P52735 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VAV2P52735 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
VAV2P52735 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VAV2P52735 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VAV2P52735 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
VAV2P52735 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VAV2P52735 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VAV2P52735 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
VAV2P52735 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VAV2P52735 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VAV2P52735 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VAV2P52735 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
VAV2P52735 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VAV2P52735 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VAV2P52735 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VAV2P52735 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VAV2P52735 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VAV2P52735 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VAV2P52735 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VAV2P52735 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VAV2P52735 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VAV2P52735 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VAV2P52735 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VAV2P52735 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
VAV2P52735 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VAV2P52735 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
VAV2P52735 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAV2P52735 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAV2P52735 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAV2P52735 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAV2P52735 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
VAV2P52735 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAV2P52735 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAV2P52735 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAV2P52735 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
VAV2P52735 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAV2P52735 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAV2P52735 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAV2P52735 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VAV2P52735 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
VAV2P52735 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VAV2P52735 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VAV2P52735 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VAV2P52735 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VAV2P52735 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VAV2P52735 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VAV2P52735 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VAV2P52735 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VAV2P52735 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VAV2P52735 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VAV2P52735 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VAV2P52735 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VAV2P52735 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VAV2P52735 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VAV2P52735 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VAV2P52735 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VAV2P52735 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VAV2P52735 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VAV2P52735 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VAV2P52735 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VAV2P52735 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VAV2P52735 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VAV2P52735 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VAV2P52735 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VAV2P52735 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VAV2P52735 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VAV2P52735 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VAV2P52735 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
VAV2P52735 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VAV2P52735 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VAV2P52735 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VAV2P52735 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VAV2P52735 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VAV2P52735 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms