Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2E1P51965 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2E1P51965 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2E1P51965 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2E1P51965 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2E1P51965 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2E1P51965 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2E1P51965 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2E1P51965 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2E1P51965 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2E1P51965 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2E1P51965 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2E1P51965 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2E1P51965 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2E1P51965 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2E1P51965 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE2E1P51965 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE2E1P51965 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE2E1P51965 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE2E1P51965 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE2E1P51965 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE2E1P51965 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE2E1P51965 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE2E1P51965 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE2E1P51965 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE2E1P51965 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE2E1P51965 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE2E1P51965 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE2E1P51965 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE2E1P51965 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE2E1P51965 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE2E1P51965 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE2E1P51965 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE2E1P51965 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE2E1P51965 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE2E1P51965 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE2E1P51965 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE2E1P51965 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE2E1P51965 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE2E1P51965 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE2E1P51965 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE2E1P51965 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE2E1P51965 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE2E1P51965 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE2E1P51965 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE2E1P51965 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE2E1P51965 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE2E1P51965 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE2E1P51965 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE2E1P51965 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE2E1P51965 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE2E1P51965 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE2E1P51965 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE2E1P51965 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE2E1P51965 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE2E1P51965 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE2E1P51965 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE2E1P51965 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE2E1P51965 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE2E1P51965 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE2E1P51965 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE2E1P51965 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE2E1P51965 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE2E1P51965 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE2E1P51965 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE2E1P51965 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE2E1P51965 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE2E1P51965 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE2E1P51965 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE2E1P51965 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE2E1P51965 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE2E1P51965 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE2E1P51965 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE2E1P51965 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE2E1P51965 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE2E1P51965 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE2E1P51965 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE2E1P51965 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE2E1P51965 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE2E1P51965 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE2E1P51965 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE2E1P51965 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE2E1P51965 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE2E1P51965 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE2E1P51965 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE2E1P51965 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE2E1P51965 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE2E1P51965 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE2E1P51965 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE2E1P51965 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE2E1P51965 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE2E1P51965 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE2E1P51965 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE2E1P51965 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE2E1P51965 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE2E1P51965 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE2E1P51965 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE2E1P51965 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE2E1P51965 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE2E1P51965 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms