Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCR4P51679 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCR4P51679 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCR4P51679 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCR4P51679 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCR4P51679 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CCR4P51679 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCR4P51679 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCR4P51679 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCR4P51679 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCR4P51679 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCR4P51679 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCR4P51679 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CCR4P51679 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCR4P51679 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCR4P51679 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCR4P51679 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCR4P51679 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCR4P51679 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCR4P51679 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCR4P51679 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCR4P51679 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CCR4P51679 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCR4P51679 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCR4P51679 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCR4P51679 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCR4P51679 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCR4P51679 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCR4P51679 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCR4P51679 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCR4P51679 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CCR4P51679 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCR4P51679 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCR4P51679 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCR4P51679 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCR4P51679 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCR4P51679 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCR4P51679 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCR4P51679 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCR4P51679 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCR4P51679 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCR4P51679 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCR4P51679 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCR4P51679 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCR4P51679 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCR4P51679 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCR4P51679 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCR4P51679 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCR4P51679 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCR4P51679 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCR4P51679 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCR4P51679 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCR4P51679 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCR4P51679 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCR4P51679 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCR4P51679 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCR4P51679 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCR4P51679 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCR4P51679 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCR4P51679 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCR4P51679 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCR4P51679 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCR4P51679 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCR4P51679 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCR4P51679 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCR4P51679 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CCR4P51679 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CCR4P51679 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCR4P51679 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCR4P51679 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCR4P51679 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCR4P51679 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCR4P51679 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCR4P51679 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCR4P51679 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCR4P51679 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCR4P51679 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCR4P51679 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCR4P51679 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCR4P51679 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCR4P51679 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCR4P51679 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCR4P51679 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCR4P51679 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCR4P51679 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCR4P51679 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCR4P51679 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCR4P51679 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCR4P51679 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCR4P51679 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCR4P51679 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCR4P51679 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CCR4P51679 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CCR4P51679 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCR4P51679 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCR4P51679 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCR4P51679 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCR4P51679 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCR4P51679 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCR4P51679 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms