Protein–RNA interactions for Protein: P51668

UBE2D1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D1P51668 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2D1P51668 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2D1P51668 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2D1P51668 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2D1P51668 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2D1P51668 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2D1P51668 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2D1P51668 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2D1P51668 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2D1P51668 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2D1P51668 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2D1P51668 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2D1P51668 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2D1P51668 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2D1P51668 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2D1P51668 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2D1P51668 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2D1P51668 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2D1P51668 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2D1P51668 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2D1P51668 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2D1P51668 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2D1P51668 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2D1P51668 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2D1P51668 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2D1P51668 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2D1P51668 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2D1P51668 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2D1P51668 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2D1P51668 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2D1P51668 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2D1P51668 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2D1P51668 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2D1P51668 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2D1P51668 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2D1P51668 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2D1P51668 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2D1P51668 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2D1P51668 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2D1P51668 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2D1P51668 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2D1P51668 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2D1P51668 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2D1P51668 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2D1P51668 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2D1P51668 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2D1P51668 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2D1P51668 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2D1P51668 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2D1P51668 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2D1P51668 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2D1P51668 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2D1P51668 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2D1P51668 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2D1P51668 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2D1P51668 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2D1P51668 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2D1P51668 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBE2D1P51668 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.1 ms