Protein–RNA interactions for Protein: P50897

PPT1, Palmitoyl-protein thioesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPT1P50897 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPT1P50897 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPT1P50897 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPT1P50897 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPT1P50897 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPT1P50897 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPT1P50897 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPT1P50897 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPT1P50897 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPT1P50897 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPT1P50897 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPT1P50897 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPT1P50897 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPT1P50897 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPT1P50897 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPT1P50897 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPT1P50897 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPT1P50897 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPT1P50897 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPT1P50897 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPT1P50897 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPT1P50897 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPT1P50897 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPT1P50897 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPT1P50897 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPT1P50897 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPT1P50897 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPT1P50897 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPT1P50897 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPT1P50897 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPT1P50897 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPT1P50897 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPT1P50897 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPT1P50897 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPT1P50897 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPT1P50897 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPT1P50897 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPT1P50897 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPT1P50897 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPT1P50897 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPT1P50897 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPT1P50897 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPT1P50897 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPT1P50897 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPT1P50897 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPT1P50897 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPT1P50897 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPT1P50897 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPT1P50897 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPT1P50897 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPT1P50897 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPT1P50897 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPT1P50897 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPT1P50897 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPT1P50897 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPT1P50897 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPT1P50897 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPT1P50897 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPT1P50897 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPT1P50897 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPT1P50897 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPT1P50897 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPT1P50897 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPT1P50897 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPT1P50897 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPT1P50897 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPT1P50897 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPT1P50897 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPT1P50897 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPT1P50897 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPT1P50897 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPT1P50897 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPT1P50897 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPT1P50897 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPT1P50897 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPT1P50897 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPT1P50897 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PPT1P50897 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPT1P50897 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPT1P50897 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPT1P50897 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPT1P50897 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPT1P50897 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPT1P50897 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPT1P50897 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPT1P50897 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPT1P50897 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PPT1P50897 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPT1P50897 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPT1P50897 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PPT1P50897 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
PPT1P50897 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPT1P50897 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPT1P50897 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPT1P50897 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPT1P50897 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPT1P50897 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPT1P50897 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPT1P50897 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPT1P50897 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms