Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSRP3P50461 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSRP3P50461 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSRP3P50461 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSRP3P50461 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSRP3P50461 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSRP3P50461 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSRP3P50461 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSRP3P50461 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSRP3P50461 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSRP3P50461 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSRP3P50461 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSRP3P50461 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSRP3P50461 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSRP3P50461 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSRP3P50461 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSRP3P50461 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSRP3P50461 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSRP3P50461 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSRP3P50461 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSRP3P50461 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSRP3P50461 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CSRP3P50461 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSRP3P50461 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSRP3P50461 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSRP3P50461 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSRP3P50461 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSRP3P50461 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSRP3P50461 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSRP3P50461 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSRP3P50461 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSRP3P50461 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSRP3P50461 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CSRP3P50461 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CSRP3P50461 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSRP3P50461 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSRP3P50461 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSRP3P50461 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSRP3P50461 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CSRP3P50461 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSRP3P50461 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSRP3P50461 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CSRP3P50461 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSRP3P50461 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSRP3P50461 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSRP3P50461 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSRP3P50461 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSRP3P50461 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSRP3P50461 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSRP3P50461 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSRP3P50461 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSRP3P50461 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSRP3P50461 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSRP3P50461 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSRP3P50461 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSRP3P50461 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSRP3P50461 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSRP3P50461 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSRP3P50461 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSRP3P50461 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSRP3P50461 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSRP3P50461 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSRP3P50461 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSRP3P50461 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSRP3P50461 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSRP3P50461 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSRP3P50461 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSRP3P50461 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSRP3P50461 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CSRP3P50461 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSRP3P50461 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSRP3P50461 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSRP3P50461 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSRP3P50461 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSRP3P50461 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSRP3P50461 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSRP3P50461 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSRP3P50461 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSRP3P50461 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSRP3P50461 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CSRP3P50461 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSRP3P50461 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSRP3P50461 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSRP3P50461 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSRP3P50461 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSRP3P50461 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSRP3P50461 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSRP3P50461 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSRP3P50461 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSRP3P50461 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSRP3P50461 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSRP3P50461 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSRP3P50461 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSRP3P50461 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CSRP3P50461 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSRP3P50461 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSRP3P50461 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSRP3P50461 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSRP3P50461 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSRP3P50461 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms