Protein–RNA interactions for Protein: P50213

IDH3A, Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDH3AP50213 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
IDH3AP50213 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IDH3AP50213 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IDH3AP50213 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IDH3AP50213 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IDH3AP50213 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IDH3AP50213 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IDH3AP50213 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IDH3AP50213 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IDH3AP50213 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IDH3AP50213 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
IDH3AP50213 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IDH3AP50213 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IDH3AP50213 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IDH3AP50213 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IDH3AP50213 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IDH3AP50213 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IDH3AP50213 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IDH3AP50213 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IDH3AP50213 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IDH3AP50213 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IDH3AP50213 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IDH3AP50213 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IDH3AP50213 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
IDH3AP50213 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IDH3AP50213 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IDH3AP50213 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IDH3AP50213 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IDH3AP50213 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IDH3AP50213 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IDH3AP50213 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IDH3AP50213 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IDH3AP50213 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IDH3AP50213 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IDH3AP50213 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IDH3AP50213 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IDH3AP50213 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IDH3AP50213 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IDH3AP50213 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
IDH3AP50213 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IDH3AP50213 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IDH3AP50213 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
IDH3AP50213 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IDH3AP50213 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IDH3AP50213 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IDH3AP50213 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IDH3AP50213 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IDH3AP50213 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IDH3AP50213 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IDH3AP50213 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IDH3AP50213 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IDH3AP50213 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IDH3AP50213 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IDH3AP50213 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
IDH3AP50213 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IDH3AP50213 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IDH3AP50213 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IDH3AP50213 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IDH3AP50213 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IDH3AP50213 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IDH3AP50213 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IDH3AP50213 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IDH3AP50213 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IDH3AP50213 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IDH3AP50213 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IDH3AP50213 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IDH3AP50213 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IDH3AP50213 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IDH3AP50213 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IDH3AP50213 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
IDH3AP50213 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IDH3AP50213 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IDH3AP50213 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
IDH3AP50213 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
IDH3AP50213 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IDH3AP50213 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IDH3AP50213 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IDH3AP50213 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IDH3AP50213 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
IDH3AP50213 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IDH3AP50213 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IDH3AP50213 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IDH3AP50213 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IDH3AP50213 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IDH3AP50213 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IDH3AP50213 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IDH3AP50213 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IDH3AP50213 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
IDH3AP50213 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IDH3AP50213 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IDH3AP50213 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IDH3AP50213 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IDH3AP50213 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IDH3AP50213 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
IDH3AP50213 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IDH3AP50213 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IDH3AP50213 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IDH3AP50213 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IDH3AP50213 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IDH3AP50213 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms