Protein–RNA interactions for Protein: P49721

PSMB2, Proteasome subunit beta type-2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB2P49721 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMB2P49721 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMB2P49721 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMB2P49721 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMB2P49721 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB2P49721 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMB2P49721 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms