Protein–RNA interactions for Protein: P49427

CDC34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC34P49427 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC34P49427 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC34P49427 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC34P49427 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC34P49427 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC34P49427 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC34P49427 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC34P49427 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC34P49427 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC34P49427 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC34P49427 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC34P49427 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC34P49427 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC34P49427 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC34P49427 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC34P49427 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC34P49427 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC34P49427 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC34P49427 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC34P49427 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC34P49427 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC34P49427 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC34P49427 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC34P49427 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC34P49427 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC34P49427 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC34P49427 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC34P49427 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC34P49427 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC34P49427 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC34P49427 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC34P49427 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC34P49427 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC34P49427 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC34P49427 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC34P49427 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC34P49427 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC34P49427 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC34P49427 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC34P49427 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC34P49427 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDC34P49427 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDC34P49427 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDC34P49427 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDC34P49427 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CDC34P49427 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC34P49427 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC34P49427 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC34P49427 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC34P49427 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC34P49427 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC34P49427 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC34P49427 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC34P49427 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC34P49427 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC34P49427 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC34P49427 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC34P49427 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC34P49427 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC34P49427 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC34P49427 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC34P49427 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC34P49427 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC34P49427 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC34P49427 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC34P49427 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC34P49427 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC34P49427 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC34P49427 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC34P49427 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC34P49427 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC34P49427 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC34P49427 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC34P49427 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC34P49427 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC34P49427 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC34P49427 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC34P49427 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC34P49427 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC34P49427 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC34P49427 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC34P49427 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC34P49427 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC34P49427 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC34P49427 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC34P49427 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC34P49427 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC34P49427 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC34P49427 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC34P49427 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC34P49427 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC34P49427 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC34P49427 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC34P49427 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC34P49427 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC34P49427 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC34P49427 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC34P49427 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC34P49427 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC34P49427 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms