Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPIAP49247 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPIAP49247 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPIAP49247 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPIAP49247 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPIAP49247 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPIAP49247 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPIAP49247 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPIAP49247 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPIAP49247 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPIAP49247 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPIAP49247 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPIAP49247 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPIAP49247 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RPIAP49247 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPIAP49247 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPIAP49247 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RPIAP49247 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RPIAP49247 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPIAP49247 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPIAP49247 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPIAP49247 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPIAP49247 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPIAP49247 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPIAP49247 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPIAP49247 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPIAP49247 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RPIAP49247 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPIAP49247 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPIAP49247 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPIAP49247 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPIAP49247 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPIAP49247 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPIAP49247 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RPIAP49247 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPIAP49247 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPIAP49247 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPIAP49247 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPIAP49247 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPIAP49247 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPIAP49247 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPIAP49247 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPIAP49247 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPIAP49247 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPIAP49247 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPIAP49247 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPIAP49247 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPIAP49247 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPIAP49247 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPIAP49247 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPIAP49247 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPIAP49247 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPIAP49247 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RPIAP49247 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPIAP49247 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPIAP49247 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPIAP49247 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPIAP49247 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPIAP49247 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPIAP49247 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RPIAP49247 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPIAP49247 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPIAP49247 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPIAP49247 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPIAP49247 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPIAP49247 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPIAP49247 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPIAP49247 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RPIAP49247 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPIAP49247 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPIAP49247 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPIAP49247 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPIAP49247 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPIAP49247 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPIAP49247 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPIAP49247 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPIAP49247 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPIAP49247 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RPIAP49247 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPIAP49247 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPIAP49247 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPIAP49247 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPIAP49247 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPIAP49247 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPIAP49247 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPIAP49247 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPIAP49247 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RPIAP49247 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPIAP49247 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPIAP49247 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPIAP49247 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPIAP49247 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPIAP49247 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPIAP49247 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPIAP49247 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPIAP49247 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPIAP49247 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPIAP49247 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPIAP49247 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPIAP49247 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms