Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GCLMP48507 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GCLMP48507 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GCLMP48507 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GCLMP48507 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GCLMP48507 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GCLMP48507 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GCLMP48507 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GCLMP48507 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GCLMP48507 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GCLMP48507 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GCLMP48507 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GCLMP48507 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GCLMP48507 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GCLMP48507 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GCLMP48507 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GCLMP48507 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GCLMP48507 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GCLMP48507 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GCLMP48507 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GCLMP48507 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GCLMP48507 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GCLMP48507 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GCLMP48507 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GCLMP48507 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GCLMP48507 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GCLMP48507 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GCLMP48507 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GCLMP48507 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GCLMP48507 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GCLMP48507 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GCLMP48507 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GCLMP48507 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GCLMP48507 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GCLMP48507 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GCLMP48507 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GCLMP48507 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GCLMP48507 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GCLMP48507 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GCLMP48507 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GCLMP48507 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GCLMP48507 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GCLMP48507 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GCLMP48507 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GCLMP48507 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GCLMP48507 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GCLMP48507 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCLMP48507 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCLMP48507 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCLMP48507 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GCLMP48507 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCLMP48507 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCLMP48507 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCLMP48507 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GCLMP48507 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GCLMP48507 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GCLMP48507 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GCLMP48507 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GCLMP48507 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GCLMP48507 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GCLMP48507 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GCLMP48507 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GCLMP48507 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCLMP48507 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCLMP48507 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCLMP48507 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCLMP48507 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCLMP48507 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCLMP48507 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCLMP48507 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCLMP48507 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCLMP48507 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCLMP48507 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCLMP48507 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCLMP48507 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCLMP48507 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCLMP48507 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GCLMP48507 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCLMP48507 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GCLMP48507 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCLMP48507 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCLMP48507 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCLMP48507 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCLMP48507 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCLMP48507 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCLMP48507 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCLMP48507 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCLMP48507 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCLMP48507 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCLMP48507 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCLMP48507 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GCLMP48507 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GCLMP48507 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GCLMP48507 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GCLMP48507 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GCLMP48507 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GCLMP48507 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GCLMP48507 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GCLMP48507 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GCLMP48507 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms