Protein–RNA interactions for Protein: P48382

RFX5, DNA-binding protein RFX5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX5P48382 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RFX5P48382 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RFX5P48382 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RFX5P48382 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RFX5P48382 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RFX5P48382 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RFX5P48382 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RFX5P48382 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RFX5P48382 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RFX5P48382 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RFX5P48382 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RFX5P48382 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
RFX5P48382 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RFX5P48382 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RFX5P48382 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RFX5P48382 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RFX5P48382 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RFX5P48382 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RFX5P48382 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RFX5P48382 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RFX5P48382 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
RFX5P48382 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RFX5P48382 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RFX5P48382 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
RFX5P48382 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RFX5P48382 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RFX5P48382 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RFX5P48382 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RFX5P48382 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RFX5P48382 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RFX5P48382 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RFX5P48382 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RFX5P48382 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RFX5P48382 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RFX5P48382 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RFX5P48382 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RFX5P48382 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RFX5P48382 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RFX5P48382 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RFX5P48382 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RFX5P48382 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RFX5P48382 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RFX5P48382 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RFX5P48382 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RFX5P48382 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RFX5P48382 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RFX5P48382 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
RFX5P48382 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RFX5P48382 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RFX5P48382 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RFX5P48382 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RFX5P48382 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RFX5P48382 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RFX5P48382 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RFX5P48382 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RFX5P48382 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RFX5P48382 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RFX5P48382 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RFX5P48382 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RFX5P48382 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RFX5P48382 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RFX5P48382 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RFX5P48382 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RFX5P48382 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RFX5P48382 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RFX5P48382 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RFX5P48382 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RFX5P48382 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RFX5P48382 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RFX5P48382 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RFX5P48382 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RFX5P48382 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RFX5P48382 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RFX5P48382 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RFX5P48382 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RFX5P48382 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RFX5P48382 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RFX5P48382 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
RFX5P48382 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RFX5P48382 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RFX5P48382 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RFX5P48382 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RFX5P48382 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RFX5P48382 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RFX5P48382 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RFX5P48382 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RFX5P48382 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RFX5P48382 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RFX5P48382 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
RFX5P48382 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RFX5P48382 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RFX5P48382 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RFX5P48382 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RFX5P48382 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RFX5P48382 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RFX5P48382 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RFX5P48382 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RFX5P48382 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RFX5P48382 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RFX5P48382 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms