Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABRA4P48169 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABRA4P48169 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABRA4P48169 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABRA4P48169 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABRA4P48169 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABRA4P48169 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABRA4P48169 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABRA4P48169 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABRA4P48169 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABRA4P48169 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABRA4P48169 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABRA4P48169 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABRA4P48169 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRA4P48169 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRA4P48169 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRA4P48169 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRA4P48169 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRA4P48169 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRA4P48169 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABRA4P48169 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABRA4P48169 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GABRA4P48169 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABRA4P48169 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABRA4P48169 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABRA4P48169 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABRA4P48169 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABRA4P48169 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABRA4P48169 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABRA4P48169 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABRA4P48169 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABRA4P48169 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABRA4P48169 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABRA4P48169 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABRA4P48169 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABRA4P48169 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABRA4P48169 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABRA4P48169 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABRA4P48169 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABRA4P48169 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABRA4P48169 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABRA4P48169 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABRA4P48169 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABRA4P48169 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABRA4P48169 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABRA4P48169 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABRA4P48169 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABRA4P48169 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABRA4P48169 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABRA4P48169 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABRA4P48169 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABRA4P48169 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GABRA4P48169 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GABRA4P48169 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GABRA4P48169 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABRA4P48169 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABRA4P48169 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABRA4P48169 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABRA4P48169 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABRA4P48169 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABRA4P48169 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GABRA4P48169 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABRA4P48169 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GABRA4P48169 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABRA4P48169 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABRA4P48169 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABRA4P48169 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GABRA4P48169 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABRA4P48169 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABRA4P48169 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABRA4P48169 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABRA4P48169 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABRA4P48169 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABRA4P48169 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABRA4P48169 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABRA4P48169 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABRA4P48169 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABRA4P48169 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABRA4P48169 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GABRA4P48169 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABRA4P48169 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABRA4P48169 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABRA4P48169 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABRA4P48169 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABRA4P48169 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABRA4P48169 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABRA4P48169 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABRA4P48169 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABRA4P48169 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABRA4P48169 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABRA4P48169 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABRA4P48169 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABRA4P48169 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABRA4P48169 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABRA4P48169 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABRA4P48169 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABRA4P48169 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABRA4P48169 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABRA4P48169 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GABRA4P48169 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms