Protein–RNA interactions for Protein: P47992

XCL1, Lymphotactin, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL1P47992 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCL1P47992 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCL1P47992 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCL1P47992 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCL1P47992 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCL1P47992 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCL1P47992 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCL1P47992 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCL1P47992 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCL1P47992 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XCL1P47992 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XCL1P47992 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XCL1P47992 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XCL1P47992 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XCL1P47992 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XCL1P47992 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XCL1P47992 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XCL1P47992 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XCL1P47992 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XCL1P47992 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XCL1P47992 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XCL1P47992 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XCL1P47992 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XCL1P47992 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XCL1P47992 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XCL1P47992 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XCL1P47992 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
XCL1P47992 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
XCL1P47992 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XCL1P47992 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XCL1P47992 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XCL1P47992 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XCL1P47992 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XCL1P47992 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XCL1P47992 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XCL1P47992 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XCL1P47992 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XCL1P47992 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
XCL1P47992 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XCL1P47992 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XCL1P47992 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XCL1P47992 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XCL1P47992 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XCL1P47992 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XCL1P47992 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
XCL1P47992 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XCL1P47992 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XCL1P47992 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XCL1P47992 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XCL1P47992 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XCL1P47992 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XCL1P47992 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XCL1P47992 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XCL1P47992 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
XCL1P47992 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XCL1P47992 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XCL1P47992 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XCL1P47992 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XCL1P47992 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XCL1P47992 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XCL1P47992 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XCL1P47992 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XCL1P47992 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XCL1P47992 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XCL1P47992 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XCL1P47992 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XCL1P47992 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XCL1P47992 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XCL1P47992 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XCL1P47992 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XCL1P47992 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XCL1P47992 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XCL1P47992 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
XCL1P47992 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
XCL1P47992 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
XCL1P47992 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
XCL1P47992 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
XCL1P47992 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XCL1P47992 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XCL1P47992 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XCL1P47992 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XCL1P47992 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
XCL1P47992 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XCL1P47992 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XCL1P47992 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XCL1P47992 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XCL1P47992 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XCL1P47992 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
XCL1P47992 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XCL1P47992 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XCL1P47992 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XCL1P47992 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XCL1P47992 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XCL1P47992 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XCL1P47992 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XCL1P47992 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XCL1P47992 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XCL1P47992 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XCL1P47992 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XCL1P47992 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms