Protein–RNA interactions for Protein: P46778

RPL21, 60S ribosomal protein L21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL21P46778 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPL21P46778 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPL21P46778 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPL21P46778 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPL21P46778 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPL21P46778 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPL21P46778 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPL21P46778 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPL21P46778 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPL21P46778 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPL21P46778 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPL21P46778 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPL21P46778 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPL21P46778 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPL21P46778 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPL21P46778 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPL21P46778 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPL21P46778 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPL21P46778 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPL21P46778 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPL21P46778 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RPL21P46778 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RPL21P46778 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPL21P46778 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPL21P46778 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPL21P46778 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPL21P46778 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPL21P46778 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RPL21P46778 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RPL21P46778 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RPL21P46778 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RPL21P46778 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPL21P46778 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPL21P46778 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPL21P46778 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPL21P46778 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPL21P46778 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPL21P46778 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPL21P46778 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPL21P46778 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPL21P46778 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPL21P46778 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPL21P46778 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPL21P46778 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPL21P46778 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RPL21P46778 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPL21P46778 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RPL21P46778 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RPL21P46778 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPL21P46778 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPL21P46778 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPL21P46778 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPL21P46778 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RPL21P46778 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPL21P46778 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPL21P46778 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPL21P46778 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPL21P46778 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPL21P46778 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPL21P46778 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPL21P46778 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPL21P46778 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPL21P46778 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPL21P46778 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPL21P46778 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPL21P46778 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPL21P46778 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPL21P46778 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPL21P46778 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPL21P46778 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPL21P46778 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPL21P46778 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPL21P46778 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPL21P46778 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPL21P46778 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPL21P46778 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPL21P46778 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPL21P46778 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPL21P46778 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RPL21P46778 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPL21P46778 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPL21P46778 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPL21P46778 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPL21P46778 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPL21P46778 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPL21P46778 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPL21P46778 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPL21P46778 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPL21P46778 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPL21P46778 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPL21P46778 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPL21P46778 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPL21P46778 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPL21P46778 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPL21P46778 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPL21P46778 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPL21P46778 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPL21P46778 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPL21P46778 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPL21P46778 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms