Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP5P45974 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP5P45974 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
USP5P45974 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
USP5P45974 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP5P45974 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP5P45974 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP5P45974 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP5P45974 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP5P45974 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP5P45974 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP5P45974 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP5P45974 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
USP5P45974 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP5P45974 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
USP5P45974 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP5P45974 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP5P45974 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP5P45974 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP5P45974 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP5P45974 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP5P45974 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP5P45974 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
USP5P45974 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP5P45974 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP5P45974 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
USP5P45974 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP5P45974 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP5P45974 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP5P45974 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP5P45974 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP5P45974 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP5P45974 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP5P45974 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP5P45974 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP5P45974 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP5P45974 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP5P45974 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP5P45974 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP5P45974 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP5P45974 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP5P45974 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP5P45974 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP5P45974 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP5P45974 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP5P45974 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP5P45974 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP5P45974 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP5P45974 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
USP5P45974 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
USP5P45974 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
USP5P45974 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP5P45974 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP5P45974 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP5P45974 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP5P45974 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP5P45974 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP5P45974 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP5P45974 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP5P45974 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP5P45974 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP5P45974 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP5P45974 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP5P45974 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP5P45974 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP5P45974 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP5P45974 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP5P45974 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP5P45974 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
USP5P45974 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP5P45974 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
USP5P45974 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP5P45974 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP5P45974 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP5P45974 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP5P45974 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP5P45974 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP5P45974 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP5P45974 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP5P45974 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP5P45974 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP5P45974 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
USP5P45974 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
USP5P45974 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
USP5P45974 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP5P45974 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP5P45974 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP5P45974 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP5P45974 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP5P45974 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP5P45974 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP5P45974 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
USP5P45974 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP5P45974 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
USP5P45974 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP5P45974 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP5P45974 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP5P45974 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP5P45974 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
USP5P45974 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms