Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACADSBP45954 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACADSBP45954 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACADSBP45954 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACADSBP45954 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACADSBP45954 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACADSBP45954 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACADSBP45954 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACADSBP45954 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ACADSBP45954 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACADSBP45954 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACADSBP45954 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACADSBP45954 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACADSBP45954 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACADSBP45954 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACADSBP45954 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACADSBP45954 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACADSBP45954 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACADSBP45954 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACADSBP45954 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACADSBP45954 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACADSBP45954 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACADSBP45954 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACADSBP45954 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACADSBP45954 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACADSBP45954 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACADSBP45954 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACADSBP45954 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ACADSBP45954 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ACADSBP45954 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACADSBP45954 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ACADSBP45954 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACADSBP45954 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACADSBP45954 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACADSBP45954 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACADSBP45954 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACADSBP45954 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACADSBP45954 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACADSBP45954 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACADSBP45954 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACADSBP45954 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACADSBP45954 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACADSBP45954 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACADSBP45954 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACADSBP45954 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACADSBP45954 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACADSBP45954 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACADSBP45954 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACADSBP45954 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACADSBP45954 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACADSBP45954 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACADSBP45954 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACADSBP45954 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACADSBP45954 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACADSBP45954 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACADSBP45954 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACADSBP45954 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACADSBP45954 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACADSBP45954 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACADSBP45954 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACADSBP45954 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACADSBP45954 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACADSBP45954 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACADSBP45954 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACADSBP45954 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACADSBP45954 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACADSBP45954 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACADSBP45954 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACADSBP45954 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACADSBP45954 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACADSBP45954 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACADSBP45954 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACADSBP45954 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACADSBP45954 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACADSBP45954 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACADSBP45954 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACADSBP45954 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACADSBP45954 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACADSBP45954 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACADSBP45954 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACADSBP45954 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACADSBP45954 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACADSBP45954 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACADSBP45954 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACADSBP45954 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACADSBP45954 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACADSBP45954 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACADSBP45954 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACADSBP45954 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACADSBP45954 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACADSBP45954 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACADSBP45954 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACADSBP45954 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACADSBP45954 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACADSBP45954 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACADSBP45954 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACADSBP45954 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACADSBP45954 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACADSBP45954 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACADSBP45954 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms