Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA4P43681 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA4P43681 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA4P43681 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA4P43681 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA4P43681 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA4P43681 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA4P43681 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA4P43681 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA4P43681 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA4P43681 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA4P43681 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA4P43681 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA4P43681 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA4P43681 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA4P43681 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNA4P43681 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNA4P43681 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNA4P43681 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNA4P43681 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNA4P43681 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNA4P43681 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNA4P43681 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNA4P43681 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNA4P43681 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA4P43681 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA4P43681 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA4P43681 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA4P43681 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA4P43681 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA4P43681 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA4P43681 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA4P43681 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA4P43681 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA4P43681 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA4P43681 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA4P43681 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHRNA4P43681 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHRNA4P43681 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHRNA4P43681 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRNA4P43681 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRNA4P43681 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRNA4P43681 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRNA4P43681 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRNA4P43681 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRNA4P43681 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRNA4P43681 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNA4P43681 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNA4P43681 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNA4P43681 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNA4P43681 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNA4P43681 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNA4P43681 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNA4P43681 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNA4P43681 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNA4P43681 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNA4P43681 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA4P43681 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA4P43681 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA4P43681 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA4P43681 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA4P43681 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA4P43681 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA4P43681 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA4P43681 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA4P43681 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA4P43681 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA4P43681 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA4P43681 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA4P43681 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA4P43681 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA4P43681 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA4P43681 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA4P43681 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA4P43681 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA4P43681 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA4P43681 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA4P43681 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA4P43681 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA4P43681 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA4P43681 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA4P43681 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA4P43681 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA4P43681 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNA4P43681 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNA4P43681 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNA4P43681 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNA4P43681 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNA4P43681 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNA4P43681 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNA4P43681 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNA4P43681 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNA4P43681 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNA4P43681 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNA4P43681 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNA4P43681 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNA4P43681 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNA4P43681 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNA4P43681 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNA4P43681 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms