Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MCAMP43121 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MCAMP43121 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MCAMP43121 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MCAMP43121 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MCAMP43121 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MCAMP43121 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MCAMP43121 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MCAMP43121 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MCAMP43121 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MCAMP43121 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MCAMP43121 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MCAMP43121 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MCAMP43121 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MCAMP43121 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MCAMP43121 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
MCAMP43121 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MCAMP43121 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MCAMP43121 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MCAMP43121 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MCAMP43121 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
MCAMP43121 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MCAMP43121 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MCAMP43121 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MCAMP43121 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MCAMP43121 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.56■■■□□ 2
MCAMP43121 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MCAMP43121 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MCAMP43121 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MCAMP43121 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MCAMP43121 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MCAMP43121 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MCAMP43121 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MCAMP43121 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
MCAMP43121 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
MCAMP43121 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MCAMP43121 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MCAMP43121 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MCAMP43121 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MCAMP43121 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MCAMP43121 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
MCAMP43121 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
MCAMP43121 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MCAMP43121 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MCAMP43121 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MCAMP43121 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.54■■■□□ 2
MCAMP43121 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.54■■■□□ 2
MCAMP43121 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MCAMP43121 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MCAMP43121 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MCAMP43121 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MCAMP43121 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
MCAMP43121 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MCAMP43121 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
MCAMP43121 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MCAMP43121 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MCAMP43121 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
MCAMP43121 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
MCAMP43121 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MCAMP43121 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MCAMP43121 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MCAMP43121 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
MCAMP43121 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MCAMP43121 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MCAMP43121 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MCAMP43121 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MCAMP43121 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MCAMP43121 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MCAMP43121 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MCAMP43121 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MCAMP43121 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MCAMP43121 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MCAMP43121 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MCAMP43121 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MCAMP43121 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
MCAMP43121 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MCAMP43121 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MCAMP43121 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MCAMP43121 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
MCAMP43121 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MCAMP43121 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MCAMP43121 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MCAMP43121 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MCAMP43121 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MCAMP43121 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MCAMP43121 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MCAMP43121 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
MCAMP43121 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MCAMP43121 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MCAMP43121 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
MCAMP43121 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MCAMP43121 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MCAMP43121 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MCAMP43121 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MCAMP43121 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
MCAMP43121 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MCAMP43121 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MCAMP43121 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MCAMP43121 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MCAMP43121 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms