Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTGER3P43115 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGER3P43115 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGER3P43115 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGER3P43115 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGER3P43115 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGER3P43115 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGER3P43115 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGER3P43115 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGER3P43115 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGER3P43115 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGER3P43115 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGER3P43115 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGER3P43115 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGER3P43115 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGER3P43115 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGER3P43115 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGER3P43115 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGER3P43115 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGER3P43115 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGER3P43115 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGER3P43115 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGER3P43115 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTGER3P43115 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTGER3P43115 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTGER3P43115 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTGER3P43115 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTGER3P43115 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTGER3P43115 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTGER3P43115 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTGER3P43115 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTGER3P43115 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTGER3P43115 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTGER3P43115 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTGER3P43115 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTGER3P43115 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTGER3P43115 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTGER3P43115 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTGER3P43115 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PTGER3P43115 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTGER3P43115 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTGER3P43115 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PTGER3P43115 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTGER3P43115 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTGER3P43115 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTGER3P43115 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTGER3P43115 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTGER3P43115 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTGER3P43115 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTGER3P43115 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTGER3P43115 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTGER3P43115 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTGER3P43115 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTGER3P43115 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTGER3P43115 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTGER3P43115 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTGER3P43115 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTGER3P43115 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTGER3P43115 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
PTGER3P43115 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTGER3P43115 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PTGER3P43115 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTGER3P43115 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTGER3P43115 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTGER3P43115 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTGER3P43115 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PTGER3P43115 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTGER3P43115 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTGER3P43115 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTGER3P43115 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTGER3P43115 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTGER3P43115 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTGER3P43115 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PTGER3P43115 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PTGER3P43115 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PTGER3P43115 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTGER3P43115 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PTGER3P43115 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PTGER3P43115 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTGER3P43115 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTGER3P43115 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTGER3P43115 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTGER3P43115 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTGER3P43115 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTGER3P43115 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PTGER3P43115 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTGER3P43115 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTGER3P43115 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTGER3P43115 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTGER3P43115 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTGER3P43115 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTGER3P43115 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTGER3P43115 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTGER3P43115 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTGER3P43115 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTGER3P43115 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTGER3P43115 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTGER3P43115 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTGER3P43115 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTGER3P43115 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms