Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDF5P43026 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDF5P43026 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDF5P43026 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDF5P43026 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDF5P43026 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GDF5P43026 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDF5P43026 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDF5P43026 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDF5P43026 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDF5P43026 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GDF5P43026 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF5P43026 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF5P43026 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF5P43026 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF5P43026 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF5P43026 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF5P43026 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF5P43026 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF5P43026 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF5P43026 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF5P43026 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDF5P43026 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDF5P43026 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDF5P43026 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDF5P43026 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDF5P43026 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDF5P43026 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDF5P43026 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDF5P43026 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDF5P43026 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDF5P43026 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDF5P43026 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDF5P43026 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF5P43026 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF5P43026 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF5P43026 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF5P43026 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF5P43026 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF5P43026 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF5P43026 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF5P43026 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF5P43026 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF5P43026 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF5P43026 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF5P43026 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF5P43026 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF5P43026 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF5P43026 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF5P43026 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF5P43026 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF5P43026 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF5P43026 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF5P43026 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF5P43026 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF5P43026 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF5P43026 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF5P43026 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF5P43026 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF5P43026 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF5P43026 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF5P43026 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF5P43026 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF5P43026 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF5P43026 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF5P43026 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF5P43026 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF5P43026 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF5P43026 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF5P43026 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF5P43026 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF5P43026 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF5P43026 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDF5P43026 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDF5P43026 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDF5P43026 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDF5P43026 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDF5P43026 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDF5P43026 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDF5P43026 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDF5P43026 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDF5P43026 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDF5P43026 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDF5P43026 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDF5P43026 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GDF5P43026 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF5P43026 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF5P43026 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF5P43026 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF5P43026 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF5P43026 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF5P43026 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF5P43026 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF5P43026 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF5P43026 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF5P43026 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF5P43026 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF5P43026 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GDF5P43026 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GDF5P43026 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms