Protein–RNA interactions for Protein: P40550

PDR11, ATP-dependent permease PDR11, yeastyeast

Predictions only

Length 1,411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PDR11P40550 RNA15YGL044C 891 nt5.77□□□□□ -1.49
PDR11P40550 YJR038CYJR038C 363 nt5.77□□□□□ -1.49
PDR11P40550 TSL1YML100W 3297 nt5.76□□□□□ -1.49
PDR11P40550 PER1YCR044C 1074 nt5.76□□□□□ -1.49
PDR11P40550 CWC2YDL209C 1020 nt5.76□□□□□ -1.49
PDR11P40550 KCC4YCL024W 3114 nt5.76□□□□□ -1.49
PDR11P40550 RAD52YML032C 1416 nt5.76□□□□□ -1.49
PDR11P40550 RDN5-1RDN5-1 121 nt5.75□□□□□ -1.49
PDR11P40550 CDC42YLR229C 576 nt5.75□□□□□ -1.49
PDR11P40550 RDN5-6RDN5-6 121 nt5.75□□□□□ -1.49
PDR11P40550 YEN1YER041W 2280 nt5.75□□□□□ -1.49
PDR11P40550 CWH43YCR017C 2862 nt5.75□□□□□ -1.49
PDR11P40550 CYM1YDR430C 2970 nt5.74□□□□□ -1.49
PDR11P40550 HEK2YBL032W 1146 nt5.74□□□□□ -1.49
PDR11P40550 FKH2YNL068C 2589 nt5.74□□□□□ -1.49
PDR11P40550 APC1YNL172W 5247 nt5.74□□□□□ -1.49
PDR11P40550 VPS69YPR087W 321 nt5.74□□□□□ -1.49
PDR11P40550 TVP38YKR088C 1014 nt5.73□□□□□ -1.49
PDR11P40550 RNR3YIL066C 2610 nt5.72□□□□□ -1.49
PDR11P40550 ROG3YFR022W 2202 nt5.72□□□□□ -1.49
PDR11P40550 VAN1YML115C 1608 nt5.72□□□□□ -1.49
PDR11P40550 IMA3YIL172C 1770 nt5.72□□□□□ -1.49
PDR11P40550 IMA4YJL221C 1770 nt5.72□□□□□ -1.49
PDR11P40550 TDA1YMR291W 1761 nt5.72□□□□□ -1.49
PDR11P40550 RPB7YDR404C 516 nt5.72□□□□□ -1.49
PDR11P40550 CWC25YNL245C 540 nt5.72□□□□□ -1.49
PDR11P40550 SUA7YPR086W 1038 nt5.72□□□□□ -1.49
PDR11P40550 UBP9YER098W 2265 nt5.72□□□□□ -1.49
PDR11P40550 FAR10YLR238W 1437 nt5.72□□□□□ -1.49
PDR11P40550 SIP5YMR140W 1470 nt5.72□□□□□ -1.49
PDR11P40550 AAD6YFL056C 639 nt5.71□□□□□ -1.5
PDR11P40550 CPA1YOR303W 1236 nt5.71□□□□□ -1.5
PDR11P40550 LTV1YKL143W 1392 nt5.71□□□□□ -1.5
PDR11P40550 YEL020CYEL020C 1683 nt5.71□□□□□ -1.5
PDR11P40550 AGA1YNR044W 2178 nt5.71□□□□□ -1.5
PDR11P40550 CLA4YNL298W 2529 nt5.71□□□□□ -1.5
PDR11P40550 VID22YLR373C 2706 nt5.7□□□□□ -1.5
PDR11P40550 BUD13YGL174W 801 nt5.7□□□□□ -1.5
PDR11P40550 YIL021C-AYIL021C-A 270 nt5.7□□□□□ -1.5
PDR11P40550 YOR1YGR281W 4434 nt5.69□□□□□ -1.5
PDR11P40550 MAL11YGR289C 1851 nt5.69□□□□□ -1.5
PDR11P40550 EAR1YMR171C 1653 nt5.69□□□□□ -1.5
PDR11P40550 PTC1YDL006W 846 nt5.69□□□□□ -1.5
PDR11P40550 VID27YNL212W 2349 nt5.69□□□□□ -1.5
PDR11P40550 AIP1YMR092C 1848 nt5.68□□□□□ -1.5
PDR11P40550 snR7-SsnR7-S 179 nt5.68□□□□□ -1.5
PDR11P40550 RAD27YKL113C 1149 nt5.68□□□□□ -1.5
PDR11P40550 MCM1YMR043W 861 nt5.68□□□□□ -1.5
PDR11P40550 EOS1YNL080C 1101 nt5.68□□□□□ -1.5
PDR11P40550 SLX1YBR228W 915 nt5.68□□□□□ -1.5
PDR11P40550 SEC39YLR440C 2130 nt5.68□□□□□ -1.5
PDR11P40550 GDB1YPR184W 4611 nt5.68□□□□□ -1.5
PDR11P40550 BOP2YLR267W 1713 nt5.67□□□□□ -1.5
PDR11P40550 RIP1YEL024W 648 nt5.67□□□□□ -1.5
PDR11P40550 DAN1YJR150C 897 nt5.67□□□□□ -1.5
PDR11P40550 MBR1YKL093W 1020 nt5.67□□□□□ -1.5
PDR11P40550 FLD1YLR404W 858 nt5.67□□□□□ -1.5
PDR11P40550 FAR8YMR029C 1572 nt5.67□□□□□ -1.5
PDR11P40550 MET4YNL103W 2019 nt5.67□□□□□ -1.5
PDR11P40550 KIN4YOR233W 2403 nt5.66□□□□□ -1.5
PDR11P40550 DBF4YDR052C 2115 nt5.66□□□□□ -1.5
PDR11P40550 BAT2YJR148W 1131 nt5.66□□□□□ -1.5
PDR11P40550 CDC48YDL126C 2508 nt5.66□□□□□ -1.5
PDR11P40550 SEC2YNL272C 2280 nt5.66□□□□□ -1.5
PDR11P40550 SSL1YLR005W 1386 nt5.65□□□□□ -1.5
PDR11P40550 MET17YLR303W 1335 nt5.65□□□□□ -1.51
PDR11P40550 PEP5YMR231W 3090 nt5.65□□□□□ -1.51
PDR11P40550 RRN3YKL125W 1884 nt5.65□□□□□ -1.51
PDR11P40550 RPS14AYCR031C 414 nt5.65□□□□□ -1.51
PDR11P40550 RMR1YGL250W 726 nt5.65□□□□□ -1.51
PDR11P40550 RFA2YNL312W 822 nt5.65□□□□□ -1.51
PDR11P40550 MRP21YBL090W 534 nt5.65□□□□□ -1.51
PDR11P40550 ECM33YBR078W 1290 nt5.65□□□□□ -1.51
PDR11P40550 TPS3YMR261C 3165 nt5.64□□□□□ -1.51
PDR11P40550 YGL199CYGL199C 471 nt5.64□□□□□ -1.51
PDR11P40550 AIM26YKL037W 357 nt5.64□□□□□ -1.51
PDR11P40550 LAS1YKR063C 1509 nt5.63□□□□□ -1.51
PDR11P40550 YHR032C-AYHR032C-A 120 nt5.63□□□□□ -1.51
PDR11P40550 SUI1YNL244C 327 nt5.63□□□□□ -1.51
PDR11P40550 NUP1YOR098C 3231 nt5.62□□□□□ -1.51
PDR11P40550 TFC7YOR110W 1308 nt5.62□□□□□ -1.51
PDR11P40550 PGM2YMR105C 1710 nt5.62□□□□□ -1.51
PDR11P40550 NUP42YDR192C 1293 nt5.62□□□□□ -1.51
PDR11P40550 VTH1YIL173W 4650 nt5.62□□□□□ -1.51
PDR11P40550 VTH2YJL222W 4650 nt5.62□□□□□ -1.51
PDR11P40550 CST6YIL036W 1764 nt5.62□□□□□ -1.51
PDR11P40550 GIP2YER054C 1647 nt5.62□□□□□ -1.51
PDR11P40550 GCV1YDR019C 1203 nt5.61□□□□□ -1.51
PDR11P40550 YDR056CYDR056C 618 nt5.61□□□□□ -1.51
PDR11P40550 MRP4YHL004W 1185 nt5.61□□□□□ -1.51
PDR11P40550 YAR030CYAR030C 342 nt5.61□□□□□ -1.51
PDR11P40550 YHR173CYHR173C 339 nt5.6□□□□□ -1.51
PDR11P40550 RPS19AYOL121C 435 nt5.6□□□□□ -1.51
PDR11P40550 ARC40YBR234C 1155 nt5.6□□□□□ -1.51
PDR11P40550 MST1YKL194C 1389 nt5.6□□□□□ -1.51
PDR11P40550 NUP2YLR335W 2163 nt5.6□□□□□ -1.51
PDR11P40550 PHO90YJL198W 2646 nt5.59□□□□□ -1.51
PDR11P40550 YGL185CYGL185C 1140 nt5.59□□□□□ -1.51
PDR11P40550 YGL214WYGL214W 486 nt5.59□□□□□ -1.51
PDR11P40550 LSB1YGR136W 726 nt5.59□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 21.8 ms