Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIK1P39086 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIK1P39086 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIK1P39086 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIK1P39086 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIK1P39086 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIK1P39086 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIK1P39086 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIK1P39086 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIK1P39086 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIK1P39086 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIK1P39086 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIK1P39086 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIK1P39086 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIK1P39086 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIK1P39086 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIK1P39086 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIK1P39086 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIK1P39086 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIK1P39086 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIK1P39086 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIK1P39086 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIK1P39086 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIK1P39086 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIK1P39086 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIK1P39086 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIK1P39086 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIK1P39086 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIK1P39086 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIK1P39086 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIK1P39086 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIK1P39086 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIK1P39086 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIK1P39086 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIK1P39086 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIK1P39086 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIK1P39086 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIK1P39086 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIK1P39086 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIK1P39086 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIK1P39086 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIK1P39086 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIK1P39086 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIK1P39086 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIK1P39086 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIK1P39086 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIK1P39086 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIK1P39086 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIK1P39086 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIK1P39086 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIK1P39086 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIK1P39086 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIK1P39086 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIK1P39086 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIK1P39086 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIK1P39086 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIK1P39086 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GRIK1P39086 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GRIK1P39086 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GRIK1P39086 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GRIK1P39086 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GRIK1P39086 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GRIK1P39086 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GRIK1P39086 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GRIK1P39086 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GRIK1P39086 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GRIK1P39086 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIK1P39086 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIK1P39086 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIK1P39086 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIK1P39086 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIK1P39086 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIK1P39086 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIK1P39086 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIK1P39086 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIK1P39086 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIK1P39086 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIK1P39086 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIK1P39086 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIK1P39086 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIK1P39086 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIK1P39086 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIK1P39086 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIK1P39086 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIK1P39086 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIK1P39086 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIK1P39086 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIK1P39086 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIK1P39086 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIK1P39086 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIK1P39086 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIK1P39086 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIK1P39086 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIK1P39086 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIK1P39086 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIK1P39086 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIK1P39086 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIK1P39086 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIK1P39086 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIK1P39086 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms