Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP62P37198 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP62P37198 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP62P37198 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP62P37198 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP62P37198 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP62P37198 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NUP62P37198 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP62P37198 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP62P37198 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP62P37198 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP62P37198 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP62P37198 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP62P37198 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP62P37198 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP62P37198 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP62P37198 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP62P37198 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP62P37198 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP62P37198 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP62P37198 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP62P37198 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP62P37198 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP62P37198 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP62P37198 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP62P37198 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP62P37198 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP62P37198 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP62P37198 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP62P37198 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP62P37198 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP62P37198 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP62P37198 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP62P37198 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP62P37198 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP62P37198 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP62P37198 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP62P37198 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP62P37198 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP62P37198 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP62P37198 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP62P37198 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP62P37198 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP62P37198 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP62P37198 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP62P37198 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP62P37198 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP62P37198 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP62P37198 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP62P37198 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP62P37198 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP62P37198 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP62P37198 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP62P37198 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP62P37198 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP62P37198 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP62P37198 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP62P37198 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP62P37198 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP62P37198 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP62P37198 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP62P37198 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP62P37198 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP62P37198 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP62P37198 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP62P37198 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP62P37198 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP62P37198 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP62P37198 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP62P37198 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP62P37198 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP62P37198 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP62P37198 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP62P37198 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP62P37198 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP62P37198 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP62P37198 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP62P37198 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP62P37198 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP62P37198 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP62P37198 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP62P37198 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP62P37198 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP62P37198 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP62P37198 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP62P37198 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP62P37198 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP62P37198 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP62P37198 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP62P37198 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP62P37198 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP62P37198 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP62P37198 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP62P37198 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NUP62P37198 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NUP62P37198 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NUP62P37198 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NUP62P37198 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP62P37198 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP62P37198 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms