Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TGFBR1P36897 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TGFBR1P36897 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TGFBR1P36897 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TGFBR1P36897 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TGFBR1P36897 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TGFBR1P36897 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TGFBR1P36897 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TGFBR1P36897 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TGFBR1P36897 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TGFBR1P36897 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TGFBR1P36897 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TGFBR1P36897 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TGFBR1P36897 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TGFBR1P36897 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TGFBR1P36897 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TGFBR1P36897 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TGFBR1P36897 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TGFBR1P36897 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TGFBR1P36897 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TGFBR1P36897 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TGFBR1P36897 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TGFBR1P36897 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TGFBR1P36897 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TGFBR1P36897 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TGFBR1P36897 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TGFBR1P36897 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TGFBR1P36897 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TGFBR1P36897 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TGFBR1P36897 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TGFBR1P36897 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TGFBR1P36897 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TGFBR1P36897 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TGFBR1P36897 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TGFBR1P36897 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TGFBR1P36897 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TGFBR1P36897 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TGFBR1P36897 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGFBR1P36897 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGFBR1P36897 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGFBR1P36897 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGFBR1P36897 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGFBR1P36897 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGFBR1P36897 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGFBR1P36897 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGFBR1P36897 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TGFBR1P36897 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TGFBR1P36897 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TGFBR1P36897 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TGFBR1P36897 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TGFBR1P36897 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TGFBR1P36897 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TGFBR1P36897 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TGFBR1P36897 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TGFBR1P36897 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TGFBR1P36897 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TGFBR1P36897 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TGFBR1P36897 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TGFBR1P36897 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TGFBR1P36897 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TGFBR1P36897 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TGFBR1P36897 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TGFBR1P36897 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TGFBR1P36897 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TGFBR1P36897 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TGFBR1P36897 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TGFBR1P36897 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TGFBR1P36897 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TGFBR1P36897 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TGFBR1P36897 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TGFBR1P36897 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TGFBR1P36897 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TGFBR1P36897 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TGFBR1P36897 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TGFBR1P36897 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TGFBR1P36897 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TGFBR1P36897 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TGFBR1P36897 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TGFBR1P36897 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TGFBR1P36897 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TGFBR1P36897 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TGFBR1P36897 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TGFBR1P36897 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TGFBR1P36897 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TGFBR1P36897 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TGFBR1P36897 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TGFBR1P36897 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TGFBR1P36897 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TGFBR1P36897 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TGFBR1P36897 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TGFBR1P36897 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TGFBR1P36897 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TGFBR1P36897 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TGFBR1P36897 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TGFBR1P36897 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TGFBR1P36897 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TGFBR1P36897 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TGFBR1P36897 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TGFBR1P36897 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TGFBR1P36897 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms