Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP5C1P36542 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP5C1P36542 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP5C1P36542 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP5C1P36542 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP5C1P36542 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP5C1P36542 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP5C1P36542 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP5C1P36542 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP5C1P36542 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP5C1P36542 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP5C1P36542 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP5C1P36542 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP5C1P36542 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP5C1P36542 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP5C1P36542 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP5C1P36542 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP5C1P36542 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP5C1P36542 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP5C1P36542 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP5C1P36542 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP5C1P36542 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP5C1P36542 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP5C1P36542 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP5C1P36542 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP5C1P36542 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP5C1P36542 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP5C1P36542 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP5C1P36542 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP5C1P36542 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP5C1P36542 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP5C1P36542 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP5C1P36542 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP5C1P36542 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP5C1P36542 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP5C1P36542 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP5C1P36542 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP5C1P36542 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP5C1P36542 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP5C1P36542 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP5C1P36542 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP5C1P36542 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP5C1P36542 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP5C1P36542 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP5C1P36542 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP5C1P36542 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP5C1P36542 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP5C1P36542 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP5C1P36542 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP5C1P36542 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP5C1P36542 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP5C1P36542 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP5C1P36542 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP5C1P36542 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP5C1P36542 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP5C1P36542 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP5C1P36542 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP5C1P36542 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP5C1P36542 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP5C1P36542 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP5C1P36542 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP5C1P36542 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP5C1P36542 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP5C1P36542 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP5C1P36542 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP5C1P36542 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP5C1P36542 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP5C1P36542 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP5C1P36542 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP5C1P36542 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP5C1P36542 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP5C1P36542 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP5C1P36542 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP5C1P36542 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP5C1P36542 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP5C1P36542 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP5C1P36542 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP5C1P36542 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP5C1P36542 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP5C1P36542 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP5C1P36542 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP5C1P36542 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP5C1P36542 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP5C1P36542 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP5C1P36542 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP5C1P36542 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP5C1P36542 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP5C1P36542 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP5C1P36542 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP5C1P36542 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP5C1P36542 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP5C1P36542 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP5C1P36542 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP5C1P36542 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP5C1P36542 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP5C1P36542 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP5C1P36542 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP5C1P36542 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP5C1P36542 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP5C1P36542 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms