Protein–RNA interactions for Protein: P35716

SOX11, Transcription factor SOX-11, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX11P35716 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOX11P35716 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOX11P35716 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SOX11P35716 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOX11P35716 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOX11P35716 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOX11P35716 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOX11P35716 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOX11P35716 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOX11P35716 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOX11P35716 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SOX11P35716 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SOX11P35716 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOX11P35716 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOX11P35716 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOX11P35716 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOX11P35716 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOX11P35716 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOX11P35716 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOX11P35716 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOX11P35716 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOX11P35716 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOX11P35716 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SOX11P35716 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SOX11P35716 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOX11P35716 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOX11P35716 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOX11P35716 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SOX11P35716 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOX11P35716 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOX11P35716 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOX11P35716 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOX11P35716 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOX11P35716 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOX11P35716 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOX11P35716 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOX11P35716 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SOX11P35716 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOX11P35716 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOX11P35716 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOX11P35716 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOX11P35716 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SOX11P35716 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SOX11P35716 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SOX11P35716 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SOX11P35716 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SOX11P35716 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SOX11P35716 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SOX11P35716 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SOX11P35716 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SOX11P35716 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SOX11P35716 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SOX11P35716 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SOX11P35716 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SOX11P35716 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SOX11P35716 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SOX11P35716 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SOX11P35716 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOX11P35716 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOX11P35716 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOX11P35716 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOX11P35716 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOX11P35716 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOX11P35716 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOX11P35716 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOX11P35716 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOX11P35716 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOX11P35716 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOX11P35716 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOX11P35716 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOX11P35716 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOX11P35716 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SOX11P35716 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SOX11P35716 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SOX11P35716 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SOX11P35716 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SOX11P35716 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SOX11P35716 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SOX11P35716 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOX11P35716 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOX11P35716 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOX11P35716 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOX11P35716 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOX11P35716 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOX11P35716 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOX11P35716 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOX11P35716 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOX11P35716 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOX11P35716 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOX11P35716 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOX11P35716 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOX11P35716 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOX11P35716 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOX11P35716 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SOX11P35716 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SOX11P35716 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SOX11P35716 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SOX11P35716 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SOX11P35716 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SOX11P35716 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms