Protein–RNA interactions for Protein: P35711

SOX5, Transcription factor SOX-5, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX5P35711 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SOX5P35711 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SOX5P35711 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SOX5P35711 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SOX5P35711 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SOX5P35711 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SOX5P35711 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SOX5P35711 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SOX5P35711 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SOX5P35711 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SOX5P35711 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SOX5P35711 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SOX5P35711 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SOX5P35711 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SOX5P35711 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SOX5P35711 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SOX5P35711 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SOX5P35711 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SOX5P35711 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SOX5P35711 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SOX5P35711 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SOX5P35711 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SOX5P35711 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SOX5P35711 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SOX5P35711 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SOX5P35711 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SOX5P35711 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SOX5P35711 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SOX5P35711 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SOX5P35711 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SOX5P35711 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SOX5P35711 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SOX5P35711 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SOX5P35711 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SOX5P35711 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SOX5P35711 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SOX5P35711 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SOX5P35711 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SOX5P35711 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SOX5P35711 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SOX5P35711 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SOX5P35711 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SOX5P35711 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SOX5P35711 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SOX5P35711 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SOX5P35711 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SOX5P35711 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SOX5P35711 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SOX5P35711 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SOX5P35711 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SOX5P35711 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SOX5P35711 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SOX5P35711 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SOX5P35711 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SOX5P35711 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SOX5P35711 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SOX5P35711 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SOX5P35711 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SOX5P35711 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SOX5P35711 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SOX5P35711 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SOX5P35711 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOX5P35711 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOX5P35711 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOX5P35711 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOX5P35711 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOX5P35711 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SOX5P35711 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SOX5P35711 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOX5P35711 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOX5P35711 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOX5P35711 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOX5P35711 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOX5P35711 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOX5P35711 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOX5P35711 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOX5P35711 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOX5P35711 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOX5P35711 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOX5P35711 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOX5P35711 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOX5P35711 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SOX5P35711 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOX5P35711 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOX5P35711 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOX5P35711 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOX5P35711 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOX5P35711 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOX5P35711 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOX5P35711 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOX5P35711 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOX5P35711 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOX5P35711 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOX5P35711 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOX5P35711 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOX5P35711 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOX5P35711 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOX5P35711 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOX5P35711 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOX5P35711 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms